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Titre : CARACTERISATION ET DISTRIBUTION DU GENE PPAX, IMPLIQUE DANS LA RESISTANCE A LA SALINITE CHEZ BACILLUS VELEZENSIS Type de document : thèse Auteurs : HALOUM Ihsane, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : Bacillus velezensis Biocontrôle Halotolérance PGPR ppaX Résistance Salinité Résumé : Face à la salinité, les rhizobactéries viennent au secours des plantes, en réduisant les effets néfastes de ce stress abiotique. En s’appuyant sur l’hypothèse que la résistance à la salinité est assurée par une protéine, ce mémoire a pour objectif d’étudier la distribution et la caractérisation du gène qui code cette protéine ; grâce au test de salinité effectué chez quatre souches de Bacillus velezensis issues de diverses niches écologiques, en mettant en pratique l’intérêt de la PCR pour amplifier ce gène, puis établir sa séquence et en concevant des modèles expérimentaux visant : (1) le clonage du gène ppaX et la vérification de sa capacité d’induire la résistance à la salinité chez E.coli, (2) la mutation du gène ppaX de Bacillus velezensis et la vérification à nouveau de sa résistance à la salinité ; (3) l’expression, la production et la purification des pyrophosphatases recombinantes et leurs anticorps correspondants ainsi que l’étude de leurs interactions protéiques. Les résultats obtenus suggèrent que ses souches ont toléré les faibles concentrations en NaCl qui ont induit leur croissance ; cependant ces bactéries ont résisté aux fortes concentrations en NaCl et s’y sont adaptées plus ou moins difficilement. Suite à la PCR, le gène ppaX a été révélé chez les quatre souches. Les alignements nucléotidique et peptidique ont permis de détecter une certaine « conservation » des séquences ppaX et Ppases chez les différentes souches étudiées. En perspectives, ces résultats et modèles expérimentaux pourront être exploités dans l’étude fonctionnelle du gène ppaX.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0332021 Président : AANNIZ Tarik Directeur : ALLAOUI Abdelmounaaim Juge : BISKRI Latefa Juge : ALLAM Loubna CARACTERISATION ET DISTRIBUTION DU GENE PPAX, IMPLIQUE DANS LA RESISTANCE A LA SALINITE CHEZ BACILLUS VELEZENSIS [thèse] / HALOUM Ihsane, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Bacillus velezensis Biocontrôle Halotolérance PGPR ppaX Résistance Salinité Résumé : Face à la salinité, les rhizobactéries viennent au secours des plantes, en réduisant les effets néfastes de ce stress abiotique. En s’appuyant sur l’hypothèse que la résistance à la salinité est assurée par une protéine, ce mémoire a pour objectif d’étudier la distribution et la caractérisation du gène qui code cette protéine ; grâce au test de salinité effectué chez quatre souches de Bacillus velezensis issues de diverses niches écologiques, en mettant en pratique l’intérêt de la PCR pour amplifier ce gène, puis établir sa séquence et en concevant des modèles expérimentaux visant : (1) le clonage du gène ppaX et la vérification de sa capacité d’induire la résistance à la salinité chez E.coli, (2) la mutation du gène ppaX de Bacillus velezensis et la vérification à nouveau de sa résistance à la salinité ; (3) l’expression, la production et la purification des pyrophosphatases recombinantes et leurs anticorps correspondants ainsi que l’étude de leurs interactions protéiques. Les résultats obtenus suggèrent que ses souches ont toléré les faibles concentrations en NaCl qui ont induit leur croissance ; cependant ces bactéries ont résisté aux fortes concentrations en NaCl et s’y sont adaptées plus ou moins difficilement. Suite à la PCR, le gène ppaX a été révélé chez les quatre souches. Les alignements nucléotidique et peptidique ont permis de détecter une certaine « conservation » des séquences ppaX et Ppases chez les différentes souches étudiées. En perspectives, ces résultats et modèles expérimentaux pourront être exploités dans l’étude fonctionnelle du gène ppaX.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0332021 Président : AANNIZ Tarik Directeur : ALLAOUI Abdelmounaaim Juge : BISKRI Latefa Juge : ALLAM Loubna Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0332021 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible MM0332021-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible Documents numériques
MM0332021URL
Titre : GENOMIC ANALYSIS OF TWO BACILLUS STRAINS: BACILLUS VELEZENSIS QA2 AND BACILLUS LICHENIFORMIS QA1, AND IDENTIFICATION OF POTENTIAL GENES INVOLVED IN PHOSPHORUS SOLUBILIZATION Type de document : thèse Auteurs : EZZAHIDI OUMAIMA, Auteur Année de publication : 2024 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Phosphorus Comparative genomics Bacillus licheniformis Bacillus velezensis WGS Phosphore Génomique comparative Bacillus licheniformis Bacillus velezensis WGS الفوسفور الجينوميات المقارنة باسيلوس ليشنيفورميس باسيلوس فيليزينس التسلسل الجينومي الكامل Résumé : Phosphorus, essential for agricultural productivity, is often inaccessible to plants due to its insoluble forms in soil. To address this challenge, our research undertakes a detailed genomic characterization of Bacillus velezensis QA2 and Bacillus licheniformis QA1. Known for their plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) traits, these strains are promising candidates for developing eco-friendly biofertilizers capable of effective phosphate solubilization.
Using advanced high-throughput whole genome and Sanger sequencing technologies, we compared the genetic structures of B. velezensis QA2 and B. licheniformis QA1 to uncover specific genetic mechanisms that facilitate phosphate mobilization. Our discoveries reveal a complex network of genes responsible for the production of organic acids and phosphatases, which play important roles in transforming insoluble phosphates into forms accessible to plants. This genetic framework enhances our understanding of B. velezensis QA2's role in promoting plant growth and its potential to reduce dependence on chemical fertilizers.
This genomic exploration significantly enriches our understanding of microbial capabilities in soil nutrient dynamics, highlighting the potential of microbial genomics in advancing sustainable agricultural technologies. By elucidating the molecular mechanisms through which these bacteria enhance soil fertility, the study lays the groundwork for targeted genetic enhancements and the strategic application of Bacillus strains in agriculture. These insights position B. velezensis QA2 and B. licheniformis QA1 as a key component in the future of biofertilizer technology, transforming agricultural practices towards sustainability.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0232024 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : Joann Karen WHALEN, Um6p ; ERRAFII Khaoula, Um6p (AGC Juge : KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik GENOMIC ANALYSIS OF TWO BACILLUS STRAINS: BACILLUS VELEZENSIS QA2 AND BACILLUS LICHENIFORMIS QA1, AND IDENTIFICATION OF POTENTIAL GENES INVOLVED IN PHOSPHORUS SOLUBILIZATION [thèse] / EZZAHIDI OUMAIMA, Auteur . - 2024.
Langues : Anglais (eng)
Mots-clés : Phosphorus Comparative genomics Bacillus licheniformis Bacillus velezensis WGS Phosphore Génomique comparative Bacillus licheniformis Bacillus velezensis WGS الفوسفور الجينوميات المقارنة باسيلوس ليشنيفورميس باسيلوس فيليزينس التسلسل الجينومي الكامل Résumé : Phosphorus, essential for agricultural productivity, is often inaccessible to plants due to its insoluble forms in soil. To address this challenge, our research undertakes a detailed genomic characterization of Bacillus velezensis QA2 and Bacillus licheniformis QA1. Known for their plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) traits, these strains are promising candidates for developing eco-friendly biofertilizers capable of effective phosphate solubilization.
Using advanced high-throughput whole genome and Sanger sequencing technologies, we compared the genetic structures of B. velezensis QA2 and B. licheniformis QA1 to uncover specific genetic mechanisms that facilitate phosphate mobilization. Our discoveries reveal a complex network of genes responsible for the production of organic acids and phosphatases, which play important roles in transforming insoluble phosphates into forms accessible to plants. This genetic framework enhances our understanding of B. velezensis QA2's role in promoting plant growth and its potential to reduce dependence on chemical fertilizers.
This genomic exploration significantly enriches our understanding of microbial capabilities in soil nutrient dynamics, highlighting the potential of microbial genomics in advancing sustainable agricultural technologies. By elucidating the molecular mechanisms through which these bacteria enhance soil fertility, the study lays the groundwork for targeted genetic enhancements and the strategic application of Bacillus strains in agriculture. These insights position B. velezensis QA2 and B. licheniformis QA1 as a key component in the future of biofertilizer technology, transforming agricultural practices towards sustainability.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0232024 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : Joann Karen WHALEN, Um6p ; ERRAFII Khaoula, Um6p (AGC Juge : KANDOUSSI Ilham Juge : AANNIZ Tarik Réservation
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