Accueil
A partir de cette page vous pouvez :
| Retourner au premier écran avec les dernières notices... |
Résultat de la recherche
3 résultat(s) recherche sur le mot-clé 'Quorum sensing' 
Affiner la recherche Faire une suggestionIN SILICO IDENTIFICATION OF POTENTIAL QUORUM SENSING INHIBITORS FOR HELICOBACTER PYLORI / BAKRI Wissal
Titre : IN SILICO IDENTIFICATION OF POTENTIAL QUORUM SENSING INHIBITORS FOR HELICOBACTER PYLORI Type de document : thèse Auteurs : BAKRI Wissal, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Quorum sensing quorum quenching multi-drug resistance molecular docking Résumé : Over the last few years, bacteria have been proven to sense their population density and alter their phenotype depending on the surrounding environment. This phenomenon, termed quorum sensing, allows the bacteria to control virulence factors and biofilm formation. In this case, Helicobacter pylori is our focus of interest due to the rising number of therapeutic failures. Complete eradication of an H. pylori infection is quickly becoming unachievable. Resistance to antibiotics is largely due to biofilm formation, a mechanism in H. pylori controlled by QS (signal molecule- AI-2) and is considered a sensitive marker for quorum sensing bacterial communication.
In this project, a new solution for the attenuation of quorum sensing was explored, which involves the use of computer assisted drug design to identify potential quorum sensing inhibitors, as a replacement for antibiotics.
Out of the 300 compounds screened, 6 candidates were computationally identified as potential QSIs due to their high binding affinity towards the chemoreceptor TlpB and low toxicity. The best candidate, β-carotene, demonstrated the highest affinity (9.2 kcal/mol) and lowest toxicity towards TlpB. It was shown to inhibit the biofilm formation of H. pylori in previous studies. This compound could be used to either stop or decrease the communication between the bacteria and inhibit the development of the QS controlled traits.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0102021 Directeur : AANIZ Tarik Juge : OUADGHIRI Mouna Juge : KANDOUSSI Ilham IN SILICO IDENTIFICATION OF POTENTIAL QUORUM SENSING INHIBITORS FOR HELICOBACTER PYLORI [thèse] / BAKRI Wissal, Auteur . - 2021.
Langues : Anglais (eng)
Mots-clés : Quorum sensing quorum quenching multi-drug resistance molecular docking Résumé : Over the last few years, bacteria have been proven to sense their population density and alter their phenotype depending on the surrounding environment. This phenomenon, termed quorum sensing, allows the bacteria to control virulence factors and biofilm formation. In this case, Helicobacter pylori is our focus of interest due to the rising number of therapeutic failures. Complete eradication of an H. pylori infection is quickly becoming unachievable. Resistance to antibiotics is largely due to biofilm formation, a mechanism in H. pylori controlled by QS (signal molecule- AI-2) and is considered a sensitive marker for quorum sensing bacterial communication.
In this project, a new solution for the attenuation of quorum sensing was explored, which involves the use of computer assisted drug design to identify potential quorum sensing inhibitors, as a replacement for antibiotics.
Out of the 300 compounds screened, 6 candidates were computationally identified as potential QSIs due to their high binding affinity towards the chemoreceptor TlpB and low toxicity. The best candidate, β-carotene, demonstrated the highest affinity (9.2 kcal/mol) and lowest toxicity towards TlpB. It was shown to inhibit the biofilm formation of H. pylori in previous studies. This compound could be used to either stop or decrease the communication between the bacteria and inhibit the development of the QS controlled traits.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0102021 Directeur : AANIZ Tarik Juge : OUADGHIRI Mouna Juge : KANDOUSSI Ilham Réservation
Réserver ce document
Exemplaires
Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0102021 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible MM0102021-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible Documents numériques
MM0102021URL
Titre : LES INFECTIONS ASSOCIEES AUX BIOFILMS Type de document : thèse Auteurs : Wafa HAJOUBI, Auteur Année de publication : 2019 Langues : Français (fre) Mots-clés : Biofilms infections Quorum qenching Quorum sensing Tolérance. Résumé : Les biofilms sont des structures hétérogènes constituées par des populations bactériennes englobées dans une matrice extracellullaire, fixées sur des surfaces naturelles ou artificielles.
Le mode de vie en biofilm est prédominant chez les organismes unicellulaires. Ce n’est que récemment que les biofilms sont admis comme le mode de vie normal et majoritaire des microorganismes responsables de nombreuses infections bactériennes qui présentent la majeure cause de la morbidité et de la mortalité en milieu hospitalier.
Dans un premier temps de ce travail, nous avons exploré les étapes de formation des biofilms et les mécanismes impliqués dans leur régulation ainsi que les pathologies impliquant ce mode de vie .Les biofilms se forme aussi bien sur les tissus superficiels ou internes de l’hôte que sur des dispositifs invasifs tels que les cathéters et les implants, les valves cardiaques, les sondes urinaires ou encore les prothèses articulaires constitueront l’élément clé de la pathogénèse des infections sur matériels.
Les biofilms sont très résistants aux antibiotiques et à la réponse immune, posant de graves problèmes de santé publique.
L’amélioration des connaissances sur les mécanismes impliqués dans la formation des biofilms et leurs résistance aux antimicrobiens, et en particulier aux antibiotiques, est devenue un challenge afin de trouver de nouveaux moyens pour prévenir ou traiter les infections associées aux biofilms. Ces moyens sont variés et font parfois appel aux nouvelles technologies (QQ, bactériophages, vaccinations …). La prévention devient beaucoup plus une nécessité qu’un choix dans la mesure où le traitement des infections associées aux biofilms demeure de plus en plus difficile à appréhender.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2122019 Président : GAOUZI.A Directeur : SEKHSOKH.Y Juge : CHADLI.M Juge : EL HAMZAOUI.S LES INFECTIONS ASSOCIEES AUX BIOFILMS [thèse] / Wafa HAJOUBI, Auteur . - 2019.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Biofilms infections Quorum qenching Quorum sensing Tolérance. Résumé : Les biofilms sont des structures hétérogènes constituées par des populations bactériennes englobées dans une matrice extracellullaire, fixées sur des surfaces naturelles ou artificielles.
Le mode de vie en biofilm est prédominant chez les organismes unicellulaires. Ce n’est que récemment que les biofilms sont admis comme le mode de vie normal et majoritaire des microorganismes responsables de nombreuses infections bactériennes qui présentent la majeure cause de la morbidité et de la mortalité en milieu hospitalier.
Dans un premier temps de ce travail, nous avons exploré les étapes de formation des biofilms et les mécanismes impliqués dans leur régulation ainsi que les pathologies impliquant ce mode de vie .Les biofilms se forme aussi bien sur les tissus superficiels ou internes de l’hôte que sur des dispositifs invasifs tels que les cathéters et les implants, les valves cardiaques, les sondes urinaires ou encore les prothèses articulaires constitueront l’élément clé de la pathogénèse des infections sur matériels.
Les biofilms sont très résistants aux antibiotiques et à la réponse immune, posant de graves problèmes de santé publique.
L’amélioration des connaissances sur les mécanismes impliqués dans la formation des biofilms et leurs résistance aux antimicrobiens, et en particulier aux antibiotiques, est devenue un challenge afin de trouver de nouveaux moyens pour prévenir ou traiter les infections associées aux biofilms. Ces moyens sont variés et font parfois appel aux nouvelles technologies (QQ, bactériophages, vaccinations …). La prévention devient beaucoup plus une nécessité qu’un choix dans la mesure où le traitement des infections associées aux biofilms demeure de plus en plus difficile à appréhender.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2122019 Président : GAOUZI.A Directeur : SEKHSOKH.Y Juge : CHADLI.M Juge : EL HAMZAOUI.S Réservation
Réserver ce document
Exemplaires
Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité M2122019 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2019 Disponible M2122019-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2019 Disponible Documents numériques
M2122019URL
Titre : INHIBITION DU QUORUM SENSING CHEZ HELICOBACTER PYLORI PAR APPROCHE IN SILICO Type de document : thèse Auteurs : WAKRIM Hajar, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : Hélicobactere pylori Quorum sensing TLPB LUXS Modeller Docking moléculaire Autodock vina Résumé : Le quorum sensing (QS) permet aux bactéries d'organiser leurs activités au niveau de la population. Il a été démontré que certaines petites molécules, connus sous le nom d'inhibiteurs de détection de quorum (QSI), bloquent efficacement le QS et atténuent par la suite la virulence bactérienne. Dans cette étude, une approche de criblage virtuel basé sur la structure (SBVS) a été utilisée pour la découverte de nouveaux candidats QSI chez hélicobacter pylori. Pour ce faire nous avons ciblé le blocage de l’activité de LUXS et TLPB, deux protéines clés de quorum sensing chez ladite bactérie. Nous avons réalisé le repositionnement de 190 médicaments en plus d’un criblage d’une base de données de 400 molécules d’origine naturelles, d’une base de données de molécules chimiques ‘Mcule’ (10000 molécules) et de 10 dérivés synthétiques. Le docking moléculaire a été réalisé via Autodock Vina, les règles de lipinski ont été vérifiées et le test de toxicité a été évalué pour les ligands ayant donnés les meilleures affinités.
Au total, 23 molécules ayant montré des meilleures affinités (entre -7,0 et -6,1 kcal/mol) envers LUXS par rapport à son ligand naturel, méthionine (-3,9 kcal/mol). Ces ligands incluent 9 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 9 molécules extraites de la base de données Mcule et 3 dérivés synthétiques. En parallèle, 30 molécules ont été retenues pour leurs fortes affinités (entre -10,0 et -8,0) envers TLPB, à savoir 17 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 7 molécules extraites de la base de données Mcule en plus de 4 dérivés synthétiques.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0452021 Président : OUADGHIIR Mouna Directeur : AANNIZ Tarik Juge : KANDOUSSI Ilham INHIBITION DU QUORUM SENSING CHEZ HELICOBACTER PYLORI PAR APPROCHE IN SILICO [thèse] / WAKRIM Hajar, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Hélicobactere pylori Quorum sensing TLPB LUXS Modeller Docking moléculaire Autodock vina Résumé : Le quorum sensing (QS) permet aux bactéries d'organiser leurs activités au niveau de la population. Il a été démontré que certaines petites molécules, connus sous le nom d'inhibiteurs de détection de quorum (QSI), bloquent efficacement le QS et atténuent par la suite la virulence bactérienne. Dans cette étude, une approche de criblage virtuel basé sur la structure (SBVS) a été utilisée pour la découverte de nouveaux candidats QSI chez hélicobacter pylori. Pour ce faire nous avons ciblé le blocage de l’activité de LUXS et TLPB, deux protéines clés de quorum sensing chez ladite bactérie. Nous avons réalisé le repositionnement de 190 médicaments en plus d’un criblage d’une base de données de 400 molécules d’origine naturelles, d’une base de données de molécules chimiques ‘Mcule’ (10000 molécules) et de 10 dérivés synthétiques. Le docking moléculaire a été réalisé via Autodock Vina, les règles de lipinski ont été vérifiées et le test de toxicité a été évalué pour les ligands ayant donnés les meilleures affinités.
Au total, 23 molécules ayant montré des meilleures affinités (entre -7,0 et -6,1 kcal/mol) envers LUXS par rapport à son ligand naturel, méthionine (-3,9 kcal/mol). Ces ligands incluent 9 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 9 molécules extraites de la base de données Mcule et 3 dérivés synthétiques. En parallèle, 30 molécules ont été retenues pour leurs fortes affinités (entre -10,0 et -8,0) envers TLPB, à savoir 17 médicaments, 2 molécules d’origine naturelle, 7 molécules extraites de la base de données Mcule en plus de 4 dérivés synthétiques.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0452021 Président : OUADGHIIR Mouna Directeur : AANNIZ Tarik Juge : KANDOUSSI Ilham Réservation
Réserver ce document
Exemplaires
Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0452021 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible MM0452021-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2021 Disponible Documents numériques
MM0452021URL
