| Titre : | EPIDEMIOLOGIE DES VIRUS RESPIRATOIRES (HORS SARS-COV-2) A L’HOPITAL MILITAIRE D’INSTRUCTION MOHAMMED V (HMIMV) DE RABAT : ETUDE RETROSPECTIVE SUR UNE PERIODE DE 44 MOIS (SEPTEMBRE 2019 – AVRIL 2023) | | Type de document : | thèse | | Auteurs : | Hajar MEHDAOUI, Auteur | | Année de publication : | 2023 | | Langues : | Français (fre) | | Mots-clés : | Virus respiratoires RT-PCR multiplexe Epidémiologie. | | Résumé : | Introduction:
Les infections respiratoires virales engendrent une morbidité et une mortalité significatives.
Les techniques moléculaires multiplexes ont permis d’optimiser la prise en charge des
patients et de mieux appréhender l'épidémiologie des virus respiratoires. L'objectif de ce
travail a été d'étudier l’épidémiologie des virus respiratoires à l’Hôpital Militaire d’Instruction
Mohammed V (HMIMV) et l’impact du SARS-CoV-2 sur la circulation de ces virus.
Matériel et méthodes:
Il s’agit d’une étude rétrospective descriptive réalisée au laboratoire de Virologie de
l’HMIMV de Rabat, de Septembre 2019 à Avril 2023. Elle a inclus tous les patients ayant
reçu un test PCR respiratoire multiplexe par le kit BioFire® Respiratory 2.1 sur un
prélèvement naso/oro-pharyngé.
Résultats:
Sur 1050 PCR réalisées, 38 % (564 patients) étaient positives. L’âge médian des patients avec
une PCR positive était de 31 ans (1-91 ans), avec une prédominance des adultes (59%). Le
sex-ratio H/F était de 1.52. Le taux de positivité variait de 57 % en 2019 et 44% en 2023.
Durant cette période, 447 PCR positives correspondaient à des mono-infections (79%) et 117
(21%) étaient des co-infections (110 à 2 virus et 7 à plus de 2 virus). Les virus les plus
fréquemment détectés étaient le Rhinovirus (38 %), suivi du virus de la grippe (16 %) et du
virus respiratoire syncytial (11 %).
Discussion /conclusion:
Les mesures barrières instaurées ont réduit la propagation des virus respiratoires. Cependant,
leur circulation a repris avec la saisonnalité après la levée de ces mesures. Dans ce contexte, il
est crucial de hiérarchiser la recherche des agents viraux en fonction du tableau respiratoire.
Le SARS-CoV-2 doit être prioritaire en période épidémique, tandis que le Rhinovirus et la
grippe sont à considérer chez l'adulte, et le Rhinovirus et le VRS chez l'enfant. En cas de
négativité avec des symptômes graves ou des facteurs de risque, un test multiplex peut être
envisagé en automne-hiver. Une sensibilisation des cliniciens aux indications des tests
multiplex pourrait optimiser les coûts. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | MS2612023 | | Directeur : | Mohammed Rida TAGAJDID |
EPIDEMIOLOGIE DES VIRUS RESPIRATOIRES (HORS SARS-COV-2) A L’HOPITAL MILITAIRE D’INSTRUCTION MOHAMMED V (HMIMV) DE RABAT : ETUDE RETROSPECTIVE SUR UNE PERIODE DE 44 MOIS (SEPTEMBRE 2019 – AVRIL 2023) [thèse] / Hajar MEHDAOUI, Auteur . - 2023. Langues : Français ( fre) | Mots-clés : | Virus respiratoires RT-PCR multiplexe Epidémiologie. | | Résumé : | Introduction:
Les infections respiratoires virales engendrent une morbidité et une mortalité significatives.
Les techniques moléculaires multiplexes ont permis d’optimiser la prise en charge des
patients et de mieux appréhender l'épidémiologie des virus respiratoires. L'objectif de ce
travail a été d'étudier l’épidémiologie des virus respiratoires à l’Hôpital Militaire d’Instruction
Mohammed V (HMIMV) et l’impact du SARS-CoV-2 sur la circulation de ces virus.
Matériel et méthodes:
Il s’agit d’une étude rétrospective descriptive réalisée au laboratoire de Virologie de
l’HMIMV de Rabat, de Septembre 2019 à Avril 2023. Elle a inclus tous les patients ayant
reçu un test PCR respiratoire multiplexe par le kit BioFire® Respiratory 2.1 sur un
prélèvement naso/oro-pharyngé.
Résultats:
Sur 1050 PCR réalisées, 38 % (564 patients) étaient positives. L’âge médian des patients avec
une PCR positive était de 31 ans (1-91 ans), avec une prédominance des adultes (59%). Le
sex-ratio H/F était de 1.52. Le taux de positivité variait de 57 % en 2019 et 44% en 2023.
Durant cette période, 447 PCR positives correspondaient à des mono-infections (79%) et 117
(21%) étaient des co-infections (110 à 2 virus et 7 à plus de 2 virus). Les virus les plus
fréquemment détectés étaient le Rhinovirus (38 %), suivi du virus de la grippe (16 %) et du
virus respiratoire syncytial (11 %).
Discussion /conclusion:
Les mesures barrières instaurées ont réduit la propagation des virus respiratoires. Cependant,
leur circulation a repris avec la saisonnalité après la levée de ces mesures. Dans ce contexte, il
est crucial de hiérarchiser la recherche des agents viraux en fonction du tableau respiratoire.
Le SARS-CoV-2 doit être prioritaire en période épidémique, tandis que le Rhinovirus et la
grippe sont à considérer chez l'adulte, et le Rhinovirus et le VRS chez l'enfant. En cas de
négativité avec des symptômes graves ou des facteurs de risque, un test multiplex peut être
envisagé en automne-hiver. Une sensibilisation des cliniciens aux indications des tests
multiplex pourrait optimiser les coûts. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | MS2612023 | | Directeur : | Mohammed Rida TAGAJDID |
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