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Titre : EVALUATION DES PERFORMANCES ANALYTIQUES (SENSIBILITE ET SPECIFICITE) DU TEST D’AMPLIFICATION RAPIDE ABBOTT ID NOW COVID-19 POUR LA DETECTION DU SARS-COV-2 Type de document : thèse Auteurs : BOUKRIT Rania, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : SARS-CoV-2 diagnostic qRT-PCR RT-LAMP ID NOW sensibilité spécificité Résumé : Lors de la pandémie COVID-19, la détection du SARS-CoV-2 repose principalement sur des tests d’amplification quantitative par polymérase en temps réel (qRT-PCR) effectués dans des laboratoires certifiés. Certes, ces tests qRT-PCR sont très sensibles et spécifiques, néanmoins ils nécessitent des analyseurs coûteux et complexes manipulés par des laborantins hautement qualifiés, de plus ils exigent généralement un délai d'exécution allant de 4h jusqu’à 6h ce qui peut entrainer un retard d’application des mesures sanitaires. Ainsi, des tests de diagnostic rapide ont été développés, tel que le test Abbott ID NOW COVID-19 basé sur l’amplification isotherme médiée par la boucle de transcription inverse (RT-LAMP) et qui est réalisé à l’aide d’un petit automate portable fournissant des résultats en 5 minutes en cas de positivité et un résultat final en 13 minutes pour les négatifs.
L’objectif de ce travail est d’évaluer la performance du test moléculaire rapide ID NOW COVID-19 en termes de sensibilité et spécificité. Il s’agit donc d’une étude observationnelle et comparative, utilisant une collection de 31 écouvillons nasopharyngés prélevés au Laboratoire Ibn Nafiss à l’intérieur de l’unité biologie moléculaire à Rabat.
L’algorithme de diagnostic dans notre étude était le dépistage des échantillons par le test moléculaire rapide RT-LAMP ID NOW-COVID-19, suivi d’une confirmation de tous les échantillons par la technique de référence qRT-PCR réalisé sur thermocycleur qTOWER.
Après analyse des données, le test moléculaire rapide ID NOW COVID-19 a donné une sensibilité de 98.9%, et une spécificité de 100%. Il ressortait donc, dans notre étude que ce test possède une excellente spécificité et une très bonne sensibilité.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0142021 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : OMARI Youssef Juge : BAHJI Mostafa EVALUATION DES PERFORMANCES ANALYTIQUES (SENSIBILITE ET SPECIFICITE) DU TEST D’AMPLIFICATION RAPIDE ABBOTT ID NOW COVID-19 POUR LA DETECTION DU SARS-COV-2 [thèse] / BOUKRIT Rania, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : SARS-CoV-2 diagnostic qRT-PCR RT-LAMP ID NOW sensibilité spécificité Résumé : Lors de la pandémie COVID-19, la détection du SARS-CoV-2 repose principalement sur des tests d’amplification quantitative par polymérase en temps réel (qRT-PCR) effectués dans des laboratoires certifiés. Certes, ces tests qRT-PCR sont très sensibles et spécifiques, néanmoins ils nécessitent des analyseurs coûteux et complexes manipulés par des laborantins hautement qualifiés, de plus ils exigent généralement un délai d'exécution allant de 4h jusqu’à 6h ce qui peut entrainer un retard d’application des mesures sanitaires. Ainsi, des tests de diagnostic rapide ont été développés, tel que le test Abbott ID NOW COVID-19 basé sur l’amplification isotherme médiée par la boucle de transcription inverse (RT-LAMP) et qui est réalisé à l’aide d’un petit automate portable fournissant des résultats en 5 minutes en cas de positivité et un résultat final en 13 minutes pour les négatifs.
L’objectif de ce travail est d’évaluer la performance du test moléculaire rapide ID NOW COVID-19 en termes de sensibilité et spécificité. Il s’agit donc d’une étude observationnelle et comparative, utilisant une collection de 31 écouvillons nasopharyngés prélevés au Laboratoire Ibn Nafiss à l’intérieur de l’unité biologie moléculaire à Rabat.
L’algorithme de diagnostic dans notre étude était le dépistage des échantillons par le test moléculaire rapide RT-LAMP ID NOW-COVID-19, suivi d’une confirmation de tous les échantillons par la technique de référence qRT-PCR réalisé sur thermocycleur qTOWER.
Après analyse des données, le test moléculaire rapide ID NOW COVID-19 a donné une sensibilité de 98.9%, et une spécificité de 100%. Il ressortait donc, dans notre étude que ce test possède une excellente spécificité et une très bonne sensibilité.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0142021 Président : OUADGHIRI Mouna Directeur : OMARI Youssef Juge : BAHJI Mostafa Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0142021 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible MM0142021-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2021 Disponible Documents numériques
MM0142021URL
Titre : ÉVALUATION DES PERFORMANCES DIAGNOSTIQUES DU KIT SERION ELISA DANS LE DIAGNOSTIC SEROLOGIQUE DE LA TOXOPLASMOSE. Type de document : thèse Auteurs : RAHIMA AGNAOU, Auteur Année de publication : 2012 Langues : Français (fre) Mots-clés : TOXOPLASMOSE SEROLOGIE SENSIBILITE SPECIFICITE ELISA Résumé : La toxoplasmose est une parasitose cosmopolite due à un protozoaire Toxoplasma gondii. Cette infection, habituellement bénigne, est particulièrement redoutable chez deux populations, la femme enceinte et le sujet immunodéprimé. Vu son caractère généralement asymptomatique, le diagnostic de la toxoplasmose repose essentiellement sur la sérologie.
L’étude a pour objectif de comparer les performances diagnostiques du Kit Serion Elisa dans le diagnostic sérologique de la Toxoplasmose à ceux obtenus par la méthode Platelia ELISA (Biorad).
Cette étude a concerné les sérums testés au laboratoire de parasitologie de l'hôpital militaire d’instruction Mohammed V de Rabat, au courant du mois de mars 2012. Les échantillons décantés et congelés au fur et à mesure de leur arrivée, ont été, après décongélation, analysés avec le toxoplasma gondii Serion ELISA classic® comme indiqué par les fabricants. L’évaluation des performances de ce kit est faite en comparaison avec le kit Platelia toxo BioRad®.
Sur les 104 sérums testés par le coffret SERION, 96 (92,3%) provenaient de femmes enceintes, tandis que les 8 autres (7,7%) provenaient de sujets immunodéprimés. Parmi les échantillons, 60 (57,7%) correspondent à des patientes non immunisées, 28 (26,92%) à des femmes enceintes immunisées, 8 (7.69%) à des cas de séroconversion. Chez les patients immunodéprimés, la sérologie est positive dans 7 cas. La concordance Kappa des deux techniques automatisées Biorad et Serion est d’environ 0,9. En effet, il est intéressant de noter qu’en dépit des variations quantitatives des titres sérologiques, le nombre de cas discordants est peu important. Concernant la sensibilité, elle est voisine des tests actuellement commercialisés et varie entre 89,7 et 91,4%. Sa spécificité est excellente.
Notre étude comparative permet de positionner le nouveau test Serion par rapport à la technique Biorad : ce dernier présente une bonne sensibilité et une spécificité excellente. Par ailleurs, la principale cause de variation inter-technique reste l’absence de démarche collective des fournisseurs, limitant ainsi l’harmonisation et la standardisation des titres et seuils proposés.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0722012 Président : EL MELLOUKI.W Directeur : LMIMOUNI.B.E Juge : MESSAOUDI.N Juge : DAMI.A ÉVALUATION DES PERFORMANCES DIAGNOSTIQUES DU KIT SERION ELISA DANS LE DIAGNOSTIC SEROLOGIQUE DE LA TOXOPLASMOSE. [thèse] / RAHIMA AGNAOU, Auteur . - 2012.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : TOXOPLASMOSE SEROLOGIE SENSIBILITE SPECIFICITE ELISA Résumé : La toxoplasmose est une parasitose cosmopolite due à un protozoaire Toxoplasma gondii. Cette infection, habituellement bénigne, est particulièrement redoutable chez deux populations, la femme enceinte et le sujet immunodéprimé. Vu son caractère généralement asymptomatique, le diagnostic de la toxoplasmose repose essentiellement sur la sérologie.
L’étude a pour objectif de comparer les performances diagnostiques du Kit Serion Elisa dans le diagnostic sérologique de la Toxoplasmose à ceux obtenus par la méthode Platelia ELISA (Biorad).
Cette étude a concerné les sérums testés au laboratoire de parasitologie de l'hôpital militaire d’instruction Mohammed V de Rabat, au courant du mois de mars 2012. Les échantillons décantés et congelés au fur et à mesure de leur arrivée, ont été, après décongélation, analysés avec le toxoplasma gondii Serion ELISA classic® comme indiqué par les fabricants. L’évaluation des performances de ce kit est faite en comparaison avec le kit Platelia toxo BioRad®.
Sur les 104 sérums testés par le coffret SERION, 96 (92,3%) provenaient de femmes enceintes, tandis que les 8 autres (7,7%) provenaient de sujets immunodéprimés. Parmi les échantillons, 60 (57,7%) correspondent à des patientes non immunisées, 28 (26,92%) à des femmes enceintes immunisées, 8 (7.69%) à des cas de séroconversion. Chez les patients immunodéprimés, la sérologie est positive dans 7 cas. La concordance Kappa des deux techniques automatisées Biorad et Serion est d’environ 0,9. En effet, il est intéressant de noter qu’en dépit des variations quantitatives des titres sérologiques, le nombre de cas discordants est peu important. Concernant la sensibilité, elle est voisine des tests actuellement commercialisés et varie entre 89,7 et 91,4%. Sa spécificité est excellente.
Notre étude comparative permet de positionner le nouveau test Serion par rapport à la technique Biorad : ce dernier présente une bonne sensibilité et une spécificité excellente. Par ailleurs, la principale cause de variation inter-technique reste l’absence de démarche collective des fournisseurs, limitant ainsi l’harmonisation et la standardisation des titres et seuils proposés.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0722012 Président : EL MELLOUKI.W Directeur : LMIMOUNI.B.E Juge : MESSAOUDI.N Juge : DAMI.A Réservation
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