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ANALYSE COMPARATIVE DE GENOME COMPLETE DE QUATRE SOUCHE DE LEISHMANIA MAJOR PAR NGS ET R / Fatima Zahrae El Bakri
Titre : ANALYSE COMPARATIVE DE GENOME COMPLETE DE QUATRE SOUCHE DE LEISHMANIA MAJOR PAR NGS ET R Type de document : thèse Auteurs : Fatima Zahrae El Bakri, Auteur Année de publication : 2020 Langues : Français (fre) Mots-clés : leishmania major NGS bio-informatique la variation de somie Appel des variant Leishmania major Next generation sequencing Bioinformatics Somy variation SNP calling Résumé : Le séquençage du génome d’un parasite est un jalon important dans l’étude de sa biologie. Quel que soit cet organisme, les outils bio-informatiques nécessaires pour comprendre son génome et le comparer aux autres génomes séquencés seront similaires. Dans cette mémoire, l’ADN génomique de parasites Leishmania major est mis à profit afin de mieux comprendre la leishmaniose cutané.
le parasite protozoaire Leishmania major est étudié par génomique comparative pour comprendre son infectivité, sa résistance aux médicaments antiparasitaire et son mode de vie dimorphique.
Le génome de l’espèce Leishmania major, qui est pathogène pour l’humain, a été comparé à quatre espèces infectant l’homme. Cette étude a suivi une analyse génomique par les outils d’alignement afin de faciliter la découverte de divers diversité génétique notamment les polymorphismes mono-nucléotidique et la somie chromosomique. Dans un contexte d'hétérogénéité génétique relative, nous avons trouvé une variation importante du nombre de copies chromosomiques entre les souche.
La question de savoir si ces différences sont suffisantes pour expliquer la gravité chez les patients est évidemment encore sujette à débat, mais nous pensons que des couches supplémentaires d'informations -omiques sont nécessaires pour compléter l'écran génomique afin de dresser une carte plus complète des déterminants de la gravité.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0172020 Président : IBRAHIMI Azeddine Directeur : Meryem Lemrani Juge : Aaniz Tarik Juge : Kartti Souad ANALYSE COMPARATIVE DE GENOME COMPLETE DE QUATRE SOUCHE DE LEISHMANIA MAJOR PAR NGS ET R [thèse] / Fatima Zahrae El Bakri, Auteur . - 2020.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : leishmania major NGS bio-informatique la variation de somie Appel des variant Leishmania major Next generation sequencing Bioinformatics Somy variation SNP calling Résumé : Le séquençage du génome d’un parasite est un jalon important dans l’étude de sa biologie. Quel que soit cet organisme, les outils bio-informatiques nécessaires pour comprendre son génome et le comparer aux autres génomes séquencés seront similaires. Dans cette mémoire, l’ADN génomique de parasites Leishmania major est mis à profit afin de mieux comprendre la leishmaniose cutané.
le parasite protozoaire Leishmania major est étudié par génomique comparative pour comprendre son infectivité, sa résistance aux médicaments antiparasitaire et son mode de vie dimorphique.
Le génome de l’espèce Leishmania major, qui est pathogène pour l’humain, a été comparé à quatre espèces infectant l’homme. Cette étude a suivi une analyse génomique par les outils d’alignement afin de faciliter la découverte de divers diversité génétique notamment les polymorphismes mono-nucléotidique et la somie chromosomique. Dans un contexte d'hétérogénéité génétique relative, nous avons trouvé une variation importante du nombre de copies chromosomiques entre les souche.
La question de savoir si ces différences sont suffisantes pour expliquer la gravité chez les patients est évidemment encore sujette à débat, mais nous pensons que des couches supplémentaires d'informations -omiques sont nécessaires pour compléter l'écran génomique afin de dresser une carte plus complète des déterminants de la gravité.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0172020 Président : IBRAHIMI Azeddine Directeur : Meryem Lemrani Juge : Aaniz Tarik Juge : Kartti Souad Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0172020 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible Documents numériques
MM0172020URL PROFIL EPIDEMIOLOGIQUE DE LA LEISHMANIOSE CUTANEE DANS LA PROVINCE DE OUARZAZATE / MERYEM SADQI
Titre : PROFIL EPIDEMIOLOGIQUE DE LA LEISHMANIOSE CUTANEE DANS LA PROVINCE DE OUARZAZATE Type de document : thèse Auteurs : MERYEM SADQI, Auteur Année de publication : 2013 Langues : Français (fre) Mots-clés : LEISHMANIA TROPICA LEISHMANIA MAJOR EPIDEMIOLOGIE OUARZAZATE PREVENTION. Résumé : Introduction : les leishmanioses constituent un problème de santé publique persistant au Maroc. Notre étude a été menée dans le but de rapporter les données de la surveillance épidémiologique de la leishmaniose cutanée dans la région d’Ouarzazate et également d‘apprécier la stratégie thérapeutique et préventive pour lutter contre cette parasitose.
Matériels et Méthode : Il s‘agit d‘une étude rétrospective d’investigation épidémiologique de la leishmaniose cutanée à partir des cas diagnostiqués et déclarés dans la région de Ouarzazate du 1er janvier 2005 au 31décembre 2010.
Ce travail est réalisé en collaboration avec le laboratoire de parasitologie et mycologie de l’hôpital militaire d’instruction Mohammed V- Rabat et le service des infrastructures et des activités ambulatoires provinciales où tous les cas diagnostiqués dans la région de Ouarzazate sont enregistrés.
Résultats : Nous avons eu une LCM de 64,4% et de LCT de 35,6%. L’âge moyen des patients est de 14,1+/- 15,97. Le sexe ratio H/F = 0,7. Les lésions siègent préférentiellement aux membres inférieurs et supérieurs suivi du visage.
Discussion : Nous avons prouvé statistiquement une relation entre le type de LC et l’âge (p=0,003), le siège des lésions (p=0), le mois de diagnostique (p=0,006). Cependant, on n’a pas pu montrer de corrélation entre le type de LC et le sexe.
Conclusion : Malgré les mesures préventives mises en place, la leishmaniose cutanée est difficile à éradiquer.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0502013 Président : TAOUFIK.J Directeur : LMIMOUNI.B.E Juge : RABHI.M Juge : AGADR.A PROFIL EPIDEMIOLOGIQUE DE LA LEISHMANIOSE CUTANEE DANS LA PROVINCE DE OUARZAZATE [thèse] / MERYEM SADQI, Auteur . - 2013.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : LEISHMANIA TROPICA LEISHMANIA MAJOR EPIDEMIOLOGIE OUARZAZATE PREVENTION. Résumé : Introduction : les leishmanioses constituent un problème de santé publique persistant au Maroc. Notre étude a été menée dans le but de rapporter les données de la surveillance épidémiologique de la leishmaniose cutanée dans la région d’Ouarzazate et également d‘apprécier la stratégie thérapeutique et préventive pour lutter contre cette parasitose.
Matériels et Méthode : Il s‘agit d‘une étude rétrospective d’investigation épidémiologique de la leishmaniose cutanée à partir des cas diagnostiqués et déclarés dans la région de Ouarzazate du 1er janvier 2005 au 31décembre 2010.
Ce travail est réalisé en collaboration avec le laboratoire de parasitologie et mycologie de l’hôpital militaire d’instruction Mohammed V- Rabat et le service des infrastructures et des activités ambulatoires provinciales où tous les cas diagnostiqués dans la région de Ouarzazate sont enregistrés.
Résultats : Nous avons eu une LCM de 64,4% et de LCT de 35,6%. L’âge moyen des patients est de 14,1+/- 15,97. Le sexe ratio H/F = 0,7. Les lésions siègent préférentiellement aux membres inférieurs et supérieurs suivi du visage.
Discussion : Nous avons prouvé statistiquement une relation entre le type de LC et l’âge (p=0,003), le siège des lésions (p=0), le mois de diagnostique (p=0,006). Cependant, on n’a pas pu montrer de corrélation entre le type de LC et le sexe.
Conclusion : Malgré les mesures préventives mises en place, la leishmaniose cutanée est difficile à éradiquer.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0502013 Président : TAOUFIK.J Directeur : LMIMOUNI.B.E Juge : RABHI.M Juge : AGADR.A Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité P0502013 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2013 Disponible P0502013-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2013 Disponible