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4 résultat(s) recherche sur le mot-clé 'Épigénétique' 
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Titre : ANALYSES BIO-INFORMATIQUES DES DONNEES GENOMIQUES, TRANSCRIPTOMIQUES ET EPIGENETIQUES DES GLIOMES GRADE II ET III Type de document : thèse Auteurs : Mohammed Amine BENDAHOU, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : Génomique Transcriptomique Épigénétique Bio-informatique Gliome de bas grade Résumé : L’utilisation des approches omiques a révolutionné la biologie et elle a conduit à l’émergence d’approches
systémiques y compris la génomique, la transcriptomique et l’épigénétique. Dans le premier chapitre, nous
avons ciblé des mutations impliquées dans les gliomes, suivi d’une analyse bio-informatique pour étudier
l’impact de ces mutations sur la structure et la fonction des 3 protéines IDH1, IDH2 et p53. Nous avons
obtenu une mutation qui a un effet sur le site catalytique de la protéine IDH1 comme R132H. D’autres
mutations de la p53 ont été identifiées comme K305N, qui est une mutation pathogène ; R175H, qui est une
mutation bénigne ; et R158G, qui perturbe la conformation structurelle de la protéine suppresseur de tumeur.
Dans le 2ème chapitre, on a identifié des biomarqueurs spécifiques pour les gliomes en analysant des données
génomiques et épigénomiques. La prévalence des mutations IDH dans le gliome de bas grade nous a guidé à
cibler leurs conséquences épigénomiques en aval, telles que G-CIMP. On a trouvé que les astrocytomes sont
caractérisés par une hyperméthylation au niveau du gène MYT1L, et les oligodendrogliomes au niveau du
gène PLCG1. Dans le 3eme chapitre, on a identifié les gènes et les miRNAs différentiellement exprimés au
niveau des gliomes. Ces biomarqueurs sont sélectionnés sur la base d’une combinaison de seuil de
changement d’expression et de seuil de score, et nous avons proposé un nouveau réseau de miARNs qui
combinent à la fois des gènes et des lncARNs spécifique pour les gliomes de bas grade. Dans le chapitre 4
on a démontré que les gliomes présentent également des altérations épigénétiques, parmi eux on trouve la
méthylation de l’ADN et leur interaction avec les modifications d’histones. Enfin, on a réussi a caractérisé
les gliomes de bas grade en analysant les diffèrents donnés omiques et on a mis en place un workflow bioinformatique précis et efficace pour analyser ces données et avoir une stratégie prometteuse pour mieux
comprendre le développement du gliomeNuméro (Thèse ou Mémoire) : D0022020 Président : IBRAHIMI Azeddine Directeur : IBRAHIMI Azeddine Juge : BADOU Abdallah Juge : OUADGHIRI Mouna Juge : SBABOU Laila-BENKABBOU Amine-BOUTARBOUH Mahjouba ANALYSES BIO-INFORMATIQUES DES DONNEES GENOMIQUES, TRANSCRIPTOMIQUES ET EPIGENETIQUES DES GLIOMES GRADE II ET III [thèse] / Mohammed Amine BENDAHOU, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Génomique Transcriptomique Épigénétique Bio-informatique Gliome de bas grade Résumé : L’utilisation des approches omiques a révolutionné la biologie et elle a conduit à l’émergence d’approches
systémiques y compris la génomique, la transcriptomique et l’épigénétique. Dans le premier chapitre, nous
avons ciblé des mutations impliquées dans les gliomes, suivi d’une analyse bio-informatique pour étudier
l’impact de ces mutations sur la structure et la fonction des 3 protéines IDH1, IDH2 et p53. Nous avons
obtenu une mutation qui a un effet sur le site catalytique de la protéine IDH1 comme R132H. D’autres
mutations de la p53 ont été identifiées comme K305N, qui est une mutation pathogène ; R175H, qui est une
mutation bénigne ; et R158G, qui perturbe la conformation structurelle de la protéine suppresseur de tumeur.
Dans le 2ème chapitre, on a identifié des biomarqueurs spécifiques pour les gliomes en analysant des données
génomiques et épigénomiques. La prévalence des mutations IDH dans le gliome de bas grade nous a guidé à
cibler leurs conséquences épigénomiques en aval, telles que G-CIMP. On a trouvé que les astrocytomes sont
caractérisés par une hyperméthylation au niveau du gène MYT1L, et les oligodendrogliomes au niveau du
gène PLCG1. Dans le 3eme chapitre, on a identifié les gènes et les miRNAs différentiellement exprimés au
niveau des gliomes. Ces biomarqueurs sont sélectionnés sur la base d’une combinaison de seuil de
changement d’expression et de seuil de score, et nous avons proposé un nouveau réseau de miARNs qui
combinent à la fois des gènes et des lncARNs spécifique pour les gliomes de bas grade. Dans le chapitre 4
on a démontré que les gliomes présentent également des altérations épigénétiques, parmi eux on trouve la
méthylation de l’ADN et leur interaction avec les modifications d’histones. Enfin, on a réussi a caractérisé
les gliomes de bas grade en analysant les diffèrents donnés omiques et on a mis en place un workflow bioinformatique précis et efficace pour analyser ces données et avoir une stratégie prometteuse pour mieux
comprendre le développement du gliomeNuméro (Thèse ou Mémoire) : D0022020 Président : IBRAHIMI Azeddine Directeur : IBRAHIMI Azeddine Juge : BADOU Abdallah Juge : OUADGHIRI Mouna Juge : SBABOU Laila-BENKABBOU Amine-BOUTARBOUH Mahjouba Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité D0022020 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Doctorat SVS 2020 Disponible D0022020-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Doctorat SVS 2020 Disponible Documents numériques
D0022020URL
Titre : CRIBLAGE IN SILICO DES INHIBITEURS DES HISTONES DESACETYLASES NAD-DEPENDANTES (SIRTUINES) AYANT UNE ACTIVITE ANTITUMORALE Type de document : thèse Auteurs : OUALLA MANAL, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : Cancer épigénétique HDAC inhibiteurs des sirtuines criblage virtuel SBDD Cancer epigenetics HDAC sirtuines inhibitors virtual screening مثبطات السرتوين الفحص الافتراضي السرطان العلم اللاجيني Résumé : Le cancer constitue un problème majeur de santé publique et fait partie des principales causes de mortalité dans le monde. Il est désormais connu que la fonction génique aberrante et les schémas altérés de l'expression génique sont des caractéristiques clés du cancer. Des preuves de plus en plus nombreuses montrent que les anomalies épigénétiques participent aux altérations responsables du dérèglement donnant lieu aux premiers stades de la néoplasie. Par conséquent, de nouveaux régimes thérapeutiques incluant des modificateurs épigénétiques ont commencé à être évalués dans le cadre des essais cliniques. Notre principal objectif dans ce travail est de concevoir de nouvelles molécules inhibitrices des sirtuines (HDAC classe III) possédant une activité anti-tumorale par le biais de la conception des médicaments en se basant sur la structure, une méthode basée sur le criblage virtuel servant à la recherche de petites molécules extraites de bases de données chimiques. Parmi les 100 composés criblés, 10 molécules candidates, possédant une énergie de liaison allant de -12,4 à -9,3 kcal/mol, ont été retenues après avoir vérifié leur conformité aux règles de Lipinski et évalué leur toxicité. Ces molécules pourraient être proposées pour la première fois comme candidates potentiellement inhibitrices des sirtuines dans le cadre d’une lutte intégrée contre le cancer. Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0452022 Président : Mouna OUADGHIRI Directeur : Tarik AANNIZ Juge : LOUATI Sara CRIBLAGE IN SILICO DES INHIBITEURS DES HISTONES DESACETYLASES NAD-DEPENDANTES (SIRTUINES) AYANT UNE ACTIVITE ANTITUMORALE [thèse] / OUALLA MANAL, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Cancer épigénétique HDAC inhibiteurs des sirtuines criblage virtuel SBDD Cancer epigenetics HDAC sirtuines inhibitors virtual screening مثبطات السرتوين الفحص الافتراضي السرطان العلم اللاجيني Résumé : Le cancer constitue un problème majeur de santé publique et fait partie des principales causes de mortalité dans le monde. Il est désormais connu que la fonction génique aberrante et les schémas altérés de l'expression génique sont des caractéristiques clés du cancer. Des preuves de plus en plus nombreuses montrent que les anomalies épigénétiques participent aux altérations responsables du dérèglement donnant lieu aux premiers stades de la néoplasie. Par conséquent, de nouveaux régimes thérapeutiques incluant des modificateurs épigénétiques ont commencé à être évalués dans le cadre des essais cliniques. Notre principal objectif dans ce travail est de concevoir de nouvelles molécules inhibitrices des sirtuines (HDAC classe III) possédant une activité anti-tumorale par le biais de la conception des médicaments en se basant sur la structure, une méthode basée sur le criblage virtuel servant à la recherche de petites molécules extraites de bases de données chimiques. Parmi les 100 composés criblés, 10 molécules candidates, possédant une énergie de liaison allant de -12,4 à -9,3 kcal/mol, ont été retenues après avoir vérifié leur conformité aux règles de Lipinski et évalué leur toxicité. Ces molécules pourraient être proposées pour la première fois comme candidates potentiellement inhibitrices des sirtuines dans le cadre d’une lutte intégrée contre le cancer. Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0452022 Président : Mouna OUADGHIRI Directeur : Tarik AANNIZ Juge : LOUATI Sara Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0452022 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible
Titre : Epigénétique : aspects généraux et médecine prédictive. Type de document : thèse Auteurs : Youssef FIHRI, Auteur Année de publication : 2018 Langues : Français (fre) Mots-clés : Epigénétique Méthylation Acétylation Alimentation Cancer Résumé : L'épigénétique correspond à l'étude des changements dans l'activité des gènes, n'impliquant pas de modification de la séquence d'ADN et pouvant être transmis lors des divisions cellulaires. Contrairement aux mutations qui affectent la séquence d'ADN, les modifications épigénétiques sont réversibles.
La méthylation de l’ADN, les modifications post-traductionnelles des histones et des ARN non codants, constituent la machinerie épigénétique et participent à l’architecture nucléaire.
Ces différents mécanismes permettent la régulation de l’expression des gènes en favorisant ou en inhibant le phénomène de la transcription au cours de la vie cellulaire.
Plusieurs facteurs contrôlent le processus épigénétique tels que l’alimentation, le tabac, l’environnement, l’activité physique, le stress et le rythme du travail.
L’épigénétique constitue à la fois la cause et le catalyseur de plusieurs pathologies notamment le cancer qui reste le domaine d’application le plus important de cette science.
Actuellement, la thérapie épigénétique constitue l’un des domaines scientifiques les plus étudiés. Par contre, les résultats restent très modestes par rapport à l’étendue des attentes.
Les premiers médicaments actuellement commercialisés comprennent la première génération d'inhibiteurs épigénétiques, soit deux inhibiteurs d’ADN méthyltransférase et trois inhibiteurs d'histone désacétylase.
Malgré que l’épigénétique reste un domaine récent, elle gagne de plus en plus d’importance notamment en matière de détermination des profils épigénétiques caractéristiques de chaque individu et le risque de survenue de maladies ; c’est ce qu’on appel : la médecine prédictive.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M1602018 Président : ZOUHDI.M Directeur : EL HAMZAOUI.S Juge : GAOUZI.A Juge : TELLAL.S Juge : SEKHSOKH.Y Epigénétique : aspects généraux et médecine prédictive. [thèse] / Youssef FIHRI, Auteur . - 2018.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Epigénétique Méthylation Acétylation Alimentation Cancer Résumé : L'épigénétique correspond à l'étude des changements dans l'activité des gènes, n'impliquant pas de modification de la séquence d'ADN et pouvant être transmis lors des divisions cellulaires. Contrairement aux mutations qui affectent la séquence d'ADN, les modifications épigénétiques sont réversibles.
La méthylation de l’ADN, les modifications post-traductionnelles des histones et des ARN non codants, constituent la machinerie épigénétique et participent à l’architecture nucléaire.
Ces différents mécanismes permettent la régulation de l’expression des gènes en favorisant ou en inhibant le phénomène de la transcription au cours de la vie cellulaire.
Plusieurs facteurs contrôlent le processus épigénétique tels que l’alimentation, le tabac, l’environnement, l’activité physique, le stress et le rythme du travail.
L’épigénétique constitue à la fois la cause et le catalyseur de plusieurs pathologies notamment le cancer qui reste le domaine d’application le plus important de cette science.
Actuellement, la thérapie épigénétique constitue l’un des domaines scientifiques les plus étudiés. Par contre, les résultats restent très modestes par rapport à l’étendue des attentes.
Les premiers médicaments actuellement commercialisés comprennent la première génération d'inhibiteurs épigénétiques, soit deux inhibiteurs d’ADN méthyltransférase et trois inhibiteurs d'histone désacétylase.
Malgré que l’épigénétique reste un domaine récent, elle gagne de plus en plus d’importance notamment en matière de détermination des profils épigénétiques caractéristiques de chaque individu et le risque de survenue de maladies ; c’est ce qu’on appel : la médecine prédictive.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M1602018 Président : ZOUHDI.M Directeur : EL HAMZAOUI.S Juge : GAOUZI.A Juge : TELLAL.S Juge : SEKHSOKH.Y Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité M1602018 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2018 Disponible M1602018-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2018 Disponible Documents numériques
M1602018URL
Titre : L’EPIGENETIQUE ET LE DIABETE. Type de document : thèse Auteurs : Oualid ROMLI, Auteur Année de publication : 2019 Langues : Français (fre) Mots-clés : Diabète Epigénétique Méthylation Acétylation Epi-médicaments Résumé : Le diabète englobe de nombreuses entités cliniques. Le DT1 et DT 2, deux extrêmes du spectre du diabète, ont des causes bien différentes, même si leurs symptômes s’apparentent dans la manifestation de la physiologie sous-jacente. Ils sont généralement irréversibles et les traitements actuels sont communément inefficaces pour stopper la progression inexorable de la maladie vers un mauvais contrôle glycémique et des complications dégénératives micro- et macrovasculaires.
Les mécanismes moléculaires sous-jacents, où interagissent des déterminants génétiques et environnementaux, sont toujours largement débattus à ce jour. Néanmoins, ils approuvent tous le déterminisme de la dérive de la machinerie épigénétique.
Ainsi, il s’avère que le diabète partage la majorité des mécanismes épigénétiques mis en cause dans les pathologies chroniques inflammatoires métaboliques ou autoimmues. Cela se manifeste plus particulièrement par le rôle des ADNs méthyltransférases (DNMTs) en cas de DT2, et par l’activité accrue des acétyltransférases (HAT) et des histones désacétyliques (HDAC) en cas de DT1.
Il est donc, clair que la régulation épigénétique des voies critiques dans la pathogenèse du diabète est envisageable. Le potentiel thérapeutique des composés qui ciblent la machinerie épigénétique dans le traitement et la gestion de la pathogenèse du diabète est globalement au stade préclinique. À court terme, les HDACi, doués d’une spécificité supérieure vis-à-vis des isoformes, semblerait être les meilleurs candidats contre le DT2. Actuellement, les thérapies basées sur les miARN / siRNA en sont à leurs balbutiements, mais leurs promesses pour l'avenir semble très efficaces pour corriger les aberrations épigénétiques du diabète.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2692019 Président : GAOUZI.A Directeur : IBRAHIMI.A Juge : ZINEB.I Juge : EL HAFIDI.N Juge : OUADGHIRI.M L’EPIGENETIQUE ET LE DIABETE. [thèse] / Oualid ROMLI, Auteur . - 2019.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Diabète Epigénétique Méthylation Acétylation Epi-médicaments Résumé : Le diabète englobe de nombreuses entités cliniques. Le DT1 et DT 2, deux extrêmes du spectre du diabète, ont des causes bien différentes, même si leurs symptômes s’apparentent dans la manifestation de la physiologie sous-jacente. Ils sont généralement irréversibles et les traitements actuels sont communément inefficaces pour stopper la progression inexorable de la maladie vers un mauvais contrôle glycémique et des complications dégénératives micro- et macrovasculaires.
Les mécanismes moléculaires sous-jacents, où interagissent des déterminants génétiques et environnementaux, sont toujours largement débattus à ce jour. Néanmoins, ils approuvent tous le déterminisme de la dérive de la machinerie épigénétique.
Ainsi, il s’avère que le diabète partage la majorité des mécanismes épigénétiques mis en cause dans les pathologies chroniques inflammatoires métaboliques ou autoimmues. Cela se manifeste plus particulièrement par le rôle des ADNs méthyltransférases (DNMTs) en cas de DT2, et par l’activité accrue des acétyltransférases (HAT) et des histones désacétyliques (HDAC) en cas de DT1.
Il est donc, clair que la régulation épigénétique des voies critiques dans la pathogenèse du diabète est envisageable. Le potentiel thérapeutique des composés qui ciblent la machinerie épigénétique dans le traitement et la gestion de la pathogenèse du diabète est globalement au stade préclinique. À court terme, les HDACi, doués d’une spécificité supérieure vis-à-vis des isoformes, semblerait être les meilleurs candidats contre le DT2. Actuellement, les thérapies basées sur les miARN / siRNA en sont à leurs balbutiements, mais leurs promesses pour l'avenir semble très efficaces pour corriger les aberrations épigénétiques du diabète.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : M2692019 Président : GAOUZI.A Directeur : IBRAHIMI.A Juge : ZINEB.I Juge : EL HAFIDI.N Juge : OUADGHIRI.M Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité M2692019 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2019 Disponible M2692019-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesMéd2019 Disponible Documents numériques
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