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ETUDE DES MUTATIONS DE RESISTANCE DU VIH 1 AUX ANTIRETROVIRAUX ARCHIVEES DANS LES PBMC CHEZ DES PATIENTS VIREMIQUES ET NON VIREMIQUES. / JOUF GHITA
Titre : ETUDE DES MUTATIONS DE RESISTANCE DU VIH 1 AUX ANTIRETROVIRAUX ARCHIVEES DANS LES PBMC CHEZ DES PATIENTS VIREMIQUES ET NON VIREMIQUES. Type de document : thèse Auteurs : JOUF GHITA, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Français (fre) Mots-clés : Génotypage du VIH traitement antirétroviral Mutations de résistance VIH-1 HIV genotyping antiretroviral therapy resistance mutations HIV-1 التنميط الجيني لفيروس العوز المناعي البشري لاج بمضادات الفيروسات التنميط الجيني لفيروس العوز المناعي البشري فيروس العوز المناعي البشري طفرات المقاومة القهقرية -1 Résumé : L’apparition croissante de souches du VIH-1 résistantes aux anti-rétroviraux a suscité de sérieuses inquiétudes concernant la transmission de virus résistants aux personnes nouvellement infectées, ce qui peut réduire l'efficacité d'un traitement antirétroviral de première ligne. Au Maroc, les données sur la résistance primaire ou pré- thérapeutique sont très limitées et méritent d’être mis à jour.
Dans la présente étude, nous nous proposons d’évaluer principalement la prévalence de la résistance primaire aux antirétroviraux (ARV) chez un groupe de patients nouvellement diagnostiqué, et secondairement, déterminer chez des patients sous traitement ARV les mutations associées à la résistance archivées dans les cellules monoculaires du sang périphérique.
Pour ce faire, une cohorte de 22 patients atteint de VIH-1, ont été inclut dans l’étude. Seize patients nouvellement confirmés VIH positifs et naïfs au traitement antirétrovirales, et 6 patients sous traitement ARV. Le gène Pol codant pour la Reverse transcriptase (RT), la Protéase (Prot) et l’intégrase (IIN) a été séquencé par NGS sur système S5. Les séquences consensus ont été analysées grâce à l'algorithmes d'interprétation de la résistance génotypique HIVdb de l'Université de Stanford.
La prévalence globale de la résistance primaire était de 37%, et Les mutations associées à la résistance aux inhibiteurs nucléosidiques et non nucléosidiques de la transcriptase réverse sont les plus fréquentes. Il s’agit principalement des mutations T215F, M184V, K70R, K103N et Y318F.
Cette étude a permis de mettre évidence le besoin urgent d’instaurer une surveillance génomique pré-thérapeutique du VIH au niveau national. Les implications de la diversité génétique du VIH doivent également être prises en compte dans la gestion de la résistance aux médicaments.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0272023 Président : Mouna OUADGHIRI Directeur : Hicham OUMZIL Juge : Tarik AANNIZ Juge : Elmir ELHARTI ETUDE DES MUTATIONS DE RESISTANCE DU VIH 1 AUX ANTIRETROVIRAUX ARCHIVEES DANS LES PBMC CHEZ DES PATIENTS VIREMIQUES ET NON VIREMIQUES. [thèse] / JOUF GHITA, Auteur . - 2023.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Génotypage du VIH traitement antirétroviral Mutations de résistance VIH-1 HIV genotyping antiretroviral therapy resistance mutations HIV-1 التنميط الجيني لفيروس العوز المناعي البشري لاج بمضادات الفيروسات التنميط الجيني لفيروس العوز المناعي البشري فيروس العوز المناعي البشري طفرات المقاومة القهقرية -1 Résumé : L’apparition croissante de souches du VIH-1 résistantes aux anti-rétroviraux a suscité de sérieuses inquiétudes concernant la transmission de virus résistants aux personnes nouvellement infectées, ce qui peut réduire l'efficacité d'un traitement antirétroviral de première ligne. Au Maroc, les données sur la résistance primaire ou pré- thérapeutique sont très limitées et méritent d’être mis à jour.
Dans la présente étude, nous nous proposons d’évaluer principalement la prévalence de la résistance primaire aux antirétroviraux (ARV) chez un groupe de patients nouvellement diagnostiqué, et secondairement, déterminer chez des patients sous traitement ARV les mutations associées à la résistance archivées dans les cellules monoculaires du sang périphérique.
Pour ce faire, une cohorte de 22 patients atteint de VIH-1, ont été inclut dans l’étude. Seize patients nouvellement confirmés VIH positifs et naïfs au traitement antirétrovirales, et 6 patients sous traitement ARV. Le gène Pol codant pour la Reverse transcriptase (RT), la Protéase (Prot) et l’intégrase (IIN) a été séquencé par NGS sur système S5. Les séquences consensus ont été analysées grâce à l'algorithmes d'interprétation de la résistance génotypique HIVdb de l'Université de Stanford.
La prévalence globale de la résistance primaire était de 37%, et Les mutations associées à la résistance aux inhibiteurs nucléosidiques et non nucléosidiques de la transcriptase réverse sont les plus fréquentes. Il s’agit principalement des mutations T215F, M184V, K70R, K103N et Y318F.
Cette étude a permis de mettre évidence le besoin urgent d’instaurer une surveillance génomique pré-thérapeutique du VIH au niveau national. Les implications de la diversité génétique du VIH doivent également être prises en compte dans la gestion de la résistance aux médicaments.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0272023 Président : Mouna OUADGHIRI Directeur : Hicham OUMZIL Juge : Tarik AANNIZ Juge : Elmir ELHARTI Réservation
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Titre : MISE AU POINT DES TESTS DE TROPISME DU VIH-1 CHEZ UNE COHORTE DE PATIENTS MAROCAINS Type de document : thèse Auteurs : AHMINA Maryam, Auteur Année de publication : 2020 Langues : Français (fre) Mots-clés : VIH-1 Corécepteur CCR5 CXCR4 Tropisme viral Test génotypique Traitement
antirétroviral HIV-1 Co-receptor CCR5 CXCR4 Viral tropism Genotypic Test antiretroviral therapy (ARV)Résumé : Contexte: Dans cette étude, nous avons étudié le tropisme des co-récepteurs du VIH-1 chez
les patients marocains naïfs aux TAR afin de faciliter l'intégration des antagonistes du CCR5
dans la pratique clinique dans cette région, ce test est demandé avant la prescription de ces
antagonistes. Méthodes: La région V3 du VIH-1 du gène env de la gp120 a été séquencée à
partir d'échantillons de plasma des 61 patients recrutés. Le tropisme génotypique a été
déterminé par quatre méthodes; Geno2pheno, PSSM, la règle du «11/25» et la règle de la charge
nette. Résultats : L'âge moyen était de 39 ans et 35 (77,8%) étaient des hommes. La
classification clinique de l'OMS a indiqué que 48,9% de ces patients étaient aux stades 3 et 4.
La charge virale médiane du VIH-1 et le nombre de cellules CD4 étaient de 87700 [26450-
255000] copies / ml et 208 [76- 379] cellules / mm3, respectivement. L'algorithme geno2pheno
avec FPR de 10% a prédit X4 chez 2 patients (4,4%) infectés par le sous-type B. Pour le soustype
C et CRF02_AG, le total de souches a montré un génotype R5. En utilisant l'outil PSSM,
1/35 (2,9%) des échantillons ont montré un génotype X4. La charge nette de la boucle V3 de
18/45 (40%) patients était ≥ +5. Le total de souches a montré un génotype R5 basé sur la
présence d'un acide aminé positif en position 11 et / ou 25 de la boucle V3. La prévalence plus
élevée des souches R5 suggère que les antagonistes du CCR5 seront des médicaments
prometteurs pour le traitement futur du SIDA au Maroc.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0022020 Président : Azeddine IBRAHIMI Directeur : Hicham EL ANNAZ Juge : Mouna OUADGHIRI Juge : Tarik AANNIZ MISE AU POINT DES TESTS DE TROPISME DU VIH-1 CHEZ UNE COHORTE DE PATIENTS MAROCAINS [thèse] / AHMINA Maryam, Auteur . - 2020.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : VIH-1 Corécepteur CCR5 CXCR4 Tropisme viral Test génotypique Traitement
antirétroviral HIV-1 Co-receptor CCR5 CXCR4 Viral tropism Genotypic Test antiretroviral therapy (ARV)Résumé : Contexte: Dans cette étude, nous avons étudié le tropisme des co-récepteurs du VIH-1 chez
les patients marocains naïfs aux TAR afin de faciliter l'intégration des antagonistes du CCR5
dans la pratique clinique dans cette région, ce test est demandé avant la prescription de ces
antagonistes. Méthodes: La région V3 du VIH-1 du gène env de la gp120 a été séquencée à
partir d'échantillons de plasma des 61 patients recrutés. Le tropisme génotypique a été
déterminé par quatre méthodes; Geno2pheno, PSSM, la règle du «11/25» et la règle de la charge
nette. Résultats : L'âge moyen était de 39 ans et 35 (77,8%) étaient des hommes. La
classification clinique de l'OMS a indiqué que 48,9% de ces patients étaient aux stades 3 et 4.
La charge virale médiane du VIH-1 et le nombre de cellules CD4 étaient de 87700 [26450-
255000] copies / ml et 208 [76- 379] cellules / mm3, respectivement. L'algorithme geno2pheno
avec FPR de 10% a prédit X4 chez 2 patients (4,4%) infectés par le sous-type B. Pour le soustype
C et CRF02_AG, le total de souches a montré un génotype R5. En utilisant l'outil PSSM,
1/35 (2,9%) des échantillons ont montré un génotype X4. La charge nette de la boucle V3 de
18/45 (40%) patients était ≥ +5. Le total de souches a montré un génotype R5 basé sur la
présence d'un acide aminé positif en position 11 et / ou 25 de la boucle V3. La prévalence plus
élevée des souches R5 suggère que les antagonistes du CCR5 seront des médicaments
prometteurs pour le traitement futur du SIDA au Maroc.Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0022020 Président : Azeddine IBRAHIMI Directeur : Hicham EL ANNAZ Juge : Mouna OUADGHIRI Juge : Tarik AANNIZ Réservation
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