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ANALYSE GENOMIQUE POUR LA CARACTERISATION DES GENES IMPLIQUES DANS L'HALOTOLERANCE DANS 4 SOUCHES DE BACILLUS / BEKKOURI ALAMI ALAE
Titre : ANALYSE GENOMIQUE POUR LA CARACTERISATION DES GENES IMPLIQUES DANS L'HALOTOLERANCE DANS 4 SOUCHES DE BACILLUS Type de document : thèse Auteurs : BEKKOURI ALAMI ALAE, Auteur Année de publication : 20MM013202424 Langues : Français (fre) Mots-clés : Halotolerance Bacillus Microbial Genomics Comparative genome analysis Whole genome Sequencing Salt stress Halotolérance Bacillus Génomique microbienne Analyse comparative des
génomes Séquençage complet du génome Stress salin تحمل الملح العصوية ،الجينومالميكروبي التحليل المقارنللجينوم تسلسل الجينوم الكامل اإلجهاد الملحيRésumé : Halotolerance is an essential microbial trait that enables survival and functioning in high-
salinity environments. This adaptive capability is particularly pertinent in Bacillus species,
which are renowned for their robustness and diverse physiological capacities. This study
focuses on the genomic analysis of four halotolerant Bacillus strains, aiming to elucidate the
genetic foundations of their ability to survive and thrive in high-salinity environments. By
employing Whole Genome Sequencing (WGS) and advanced comparative genomic techniques,
we identified and characterized the genes and genomic features responsible for halotolerance.
Our analysis revealed the presence of specific gene clusters, including those involved in
osmoprotectant synthesis, ion transport, and stress response, which are pivotal for maintaining
cellular homeostasis salt stress. Additionally, phylogenetic analysis were performed and
sequence alignment indicated significant genetic divergence among the strains, suggesting
diverse evolutionary strategies for coping with salinity. Comparative genomics highlighted the
presence of unique adaptive genes and mobile genetic elements that may have been acquired
through horizontal gene transfer, further enhancing the halotolerance capabilities of these
Bacillus strains.
The findings from this study offer a comprehensive understanding of the molecular mechanisms
of halotolerance in Bacillus, with potential applications in biotechnology, such as the
development of salt-tolerant crops and bioremediation strategies. This research contributes to
the broader field of microbial adaptation to extreme environments and underscores the
importance of microbial genomic studies in uncovering the genetic basis of environmental
resilienceNuméro (Thèse ou Mémoire) : MM0132024 Président : AANNIZ Tarik Directeur : OUEDGHIRI Mouna Juge : ERRAFII Khaoula Juge : KANDOUSSI Ilham Juge : BOUZROUD Sarah ANALYSE GENOMIQUE POUR LA CARACTERISATION DES GENES IMPLIQUES DANS L'HALOTOLERANCE DANS 4 SOUCHES DE BACILLUS [thèse] / BEKKOURI ALAMI ALAE, Auteur . - 20MM013202424.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Halotolerance Bacillus Microbial Genomics Comparative genome analysis Whole genome Sequencing Salt stress Halotolérance Bacillus Génomique microbienne Analyse comparative des
génomes Séquençage complet du génome Stress salin تحمل الملح العصوية ،الجينومالميكروبي التحليل المقارنللجينوم تسلسل الجينوم الكامل اإلجهاد الملحيRésumé : Halotolerance is an essential microbial trait that enables survival and functioning in high-
salinity environments. This adaptive capability is particularly pertinent in Bacillus species,
which are renowned for their robustness and diverse physiological capacities. This study
focuses on the genomic analysis of four halotolerant Bacillus strains, aiming to elucidate the
genetic foundations of their ability to survive and thrive in high-salinity environments. By
employing Whole Genome Sequencing (WGS) and advanced comparative genomic techniques,
we identified and characterized the genes and genomic features responsible for halotolerance.
Our analysis revealed the presence of specific gene clusters, including those involved in
osmoprotectant synthesis, ion transport, and stress response, which are pivotal for maintaining
cellular homeostasis salt stress. Additionally, phylogenetic analysis were performed and
sequence alignment indicated significant genetic divergence among the strains, suggesting
diverse evolutionary strategies for coping with salinity. Comparative genomics highlighted the
presence of unique adaptive genes and mobile genetic elements that may have been acquired
through horizontal gene transfer, further enhancing the halotolerance capabilities of these
Bacillus strains.
The findings from this study offer a comprehensive understanding of the molecular mechanisms
of halotolerance in Bacillus, with potential applications in biotechnology, such as the
development of salt-tolerant crops and bioremediation strategies. This research contributes to
the broader field of microbial adaptation to extreme environments and underscores the
importance of microbial genomic studies in uncovering the genetic basis of environmental
resilienceNuméro (Thèse ou Mémoire) : MM0132024 Président : AANNIZ Tarik Directeur : OUEDGHIRI Mouna Juge : ERRAFII Khaoula Juge : KANDOUSSI Ilham Juge : BOUZROUD Sarah Réservation
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Exemplaires
Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0132024 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible CARACTERISATION ET DISTRIBUTION DU GENE PPAX, IMPLIQUE DANS LA RESISTANCE A LA SALINITE CHEZ BACILLUS VELEZENSIS / HALOUM Ihsane
Titre : CARACTERISATION ET DISTRIBUTION DU GENE PPAX, IMPLIQUE DANS LA RESISTANCE A LA SALINITE CHEZ BACILLUS VELEZENSIS Type de document : thèse Auteurs : HALOUM Ihsane, Auteur Année de publication : 2021 Langues : Français (fre) Mots-clés : Bacillus velezensis Biocontrôle Halotolérance PGPR ppaX Résistance Salinité Résumé : Face à la salinité, les rhizobactéries viennent au secours des plantes, en réduisant les effets néfastes de ce stress abiotique. En s’appuyant sur l’hypothèse que la résistance à la salinité est assurée par une protéine, ce mémoire a pour objectif d’étudier la distribution et la caractérisation du gène qui code cette protéine ; grâce au test de salinité effectué chez quatre souches de Bacillus velezensis issues de diverses niches écologiques, en mettant en pratique l’intérêt de la PCR pour amplifier ce gène, puis établir sa séquence et en concevant des modèles expérimentaux visant : (1) le clonage du gène ppaX et la vérification de sa capacité d’induire la résistance à la salinité chez E.coli, (2) la mutation du gène ppaX de Bacillus velezensis et la vérification à nouveau de sa résistance à la salinité ; (3) l’expression, la production et la purification des pyrophosphatases recombinantes et leurs anticorps correspondants ainsi que l’étude de leurs interactions protéiques. Les résultats obtenus suggèrent que ses souches ont toléré les faibles concentrations en NaCl qui ont induit leur croissance ; cependant ces bactéries ont résisté aux fortes concentrations en NaCl et s’y sont adaptées plus ou moins difficilement. Suite à la PCR, le gène ppaX a été révélé chez les quatre souches. Les alignements nucléotidique et peptidique ont permis de détecter une certaine « conservation » des séquences ppaX et Ppases chez les différentes souches étudiées. En perspectives, ces résultats et modèles expérimentaux pourront être exploités dans l’étude fonctionnelle du gène ppaX.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0332021 Président : AANNIZ Tarik Directeur : ALLAOUI Abdelmounaaim Juge : BISKRI Latefa Juge : ALLAM Loubna CARACTERISATION ET DISTRIBUTION DU GENE PPAX, IMPLIQUE DANS LA RESISTANCE A LA SALINITE CHEZ BACILLUS VELEZENSIS [thèse] / HALOUM Ihsane, Auteur . - 2021.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Bacillus velezensis Biocontrôle Halotolérance PGPR ppaX Résistance Salinité Résumé : Face à la salinité, les rhizobactéries viennent au secours des plantes, en réduisant les effets néfastes de ce stress abiotique. En s’appuyant sur l’hypothèse que la résistance à la salinité est assurée par une protéine, ce mémoire a pour objectif d’étudier la distribution et la caractérisation du gène qui code cette protéine ; grâce au test de salinité effectué chez quatre souches de Bacillus velezensis issues de diverses niches écologiques, en mettant en pratique l’intérêt de la PCR pour amplifier ce gène, puis établir sa séquence et en concevant des modèles expérimentaux visant : (1) le clonage du gène ppaX et la vérification de sa capacité d’induire la résistance à la salinité chez E.coli, (2) la mutation du gène ppaX de Bacillus velezensis et la vérification à nouveau de sa résistance à la salinité ; (3) l’expression, la production et la purification des pyrophosphatases recombinantes et leurs anticorps correspondants ainsi que l’étude de leurs interactions protéiques. Les résultats obtenus suggèrent que ses souches ont toléré les faibles concentrations en NaCl qui ont induit leur croissance ; cependant ces bactéries ont résisté aux fortes concentrations en NaCl et s’y sont adaptées plus ou moins difficilement. Suite à la PCR, le gène ppaX a été révélé chez les quatre souches. Les alignements nucléotidique et peptidique ont permis de détecter une certaine « conservation » des séquences ppaX et Ppases chez les différentes souches étudiées. En perspectives, ces résultats et modèles expérimentaux pourront être exploités dans l’étude fonctionnelle du gène ppaX.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : MM0332021 Président : AANNIZ Tarik Directeur : ALLAOUI Abdelmounaaim Juge : BISKRI Latefa Juge : ALLAM Loubna Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité MM0332021 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible MM0332021-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Mémoires de Masters Disponible Documents numériques
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