| Titre : | ETUDE DU MÉCANISME D’INTERACTION ET DE SIGNALISATION DES ACIDES GRAS VIA CD36 AVEC ET SANS INFECTION À LA COVID 19 : DÉVELOPPEMENT DE WORKFLOW D’IDENTIFICATION DE MOLÉCULES BIOACTIVES IN SILICO | | Type de document : | thèse | | Auteurs : | JIHANE AKACHAR, Auteur | | Année de publication : | 2022 | | Langues : | Français (fre) | | Mots-clés : | Acide gras CD36 Dynamique moléculaire Modélisation moléculaire Bioinformatique Conception de molécule COVID19 Fatty acid CD36 Molecular dynamics Molecular modeling Bioinformatics Molecule
design COVID19 األحماضالدهنية CD36 الدينامياتالجزيئية النمذجةالجزيئية المعلوماتيةالحيوية تصميمالجزيئات COVID19 | | Résumé : | Une consommation excessive de lipides en particulier d’Acides Gras Saturés associé à un
déséquilibre qualitatif contribue à la prévalence de l’obésité. Le récepteurs lipidiques CD36 est un
candidat plausible en tant que capteur lipidique gustatif, également induisant une cascade de
signalisation cellulaire. Le but de cette thèse a été la conception, le criblage et l'identification de
nouvelles molécules bioactives par le développement de workflow basés sur l’approche in silico.
Nous avons utilisé des séries de simulations de dynamique moléculaire de la protéine CD36, en
interaction avec un à trois acides palmitiques (PLM), afin d'établir un premier workflow pour
découvrir le mécanisme du fonctionnement du complexe CD36/Acides gras et de déterminer le rôle
structural de la Lys 164. Les résultats ont montré que la Lys164 influence d'une manière importante
sur la forme de stabilité du CD36 et. La conception grâce aux résultats du premier workflow de 15
molécules activant la voie de signalisation des acides gras et plus particulièrement ceux qui sont
spécifiques au goût de gras. Uniquement, l'analogue CIN4 a montré, par la suite, par criblage
dynamique, une dimérisation des deux domaines TM1 et TM2 qui ressemble à l'acide palmitique.
En outre, les étapes de ce premier workflow ont permis d'explorer le dysfonctionnement gustatif de
la chimio-réception des acides gras spécifiquement le "goût de gras" des patients testés positifs au
COVID-19. Les résultats de cette étude ont montré une affinité élevée et une stabilité du domaine
RBD du SARS-CoV-2 non mutant au récepteur CD36, un deuxième workflow a été établit. Le
criblage virtuel a été utilisé dans un premier temps pour identifier les épitopes critiques pour trois
cibles (CD147, CD209 et CD299). Les résultats ont montré une affinité élevée du domaine RBD du
SARS-CoV-2 pour le récepteur CD299. Le CD36 et CD299 représente, donc, une cible puissante
pour la découverte et la conception d'un nouveau groupe thérapeutiques ciblant le
dysfonctionnement du goût par le Covid 19 et neutralisant le SRAS-CoV-2. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | D0322021 | | Président : | M’hammed ANSAR | | Directeur : | Rachid EL JAOUDI ; Azeddine IBRAHIMI Co-Directeur de thèse | | Juge : | Anas KETTANI | | Juge : | Khalil HAMMANI | | Juge : | EL HARTI Jaouad ; Youssef RAMLI |
ETUDE DU MÉCANISME D’INTERACTION ET DE SIGNALISATION DES ACIDES GRAS VIA CD36 AVEC ET SANS INFECTION À LA COVID 19 : DÉVELOPPEMENT DE WORKFLOW D’IDENTIFICATION DE MOLÉCULES BIOACTIVES IN SILICO [thèse] / JIHANE AKACHAR, Auteur . - 2022. Langues : Français ( fre) | Mots-clés : | Acide gras CD36 Dynamique moléculaire Modélisation moléculaire Bioinformatique Conception de molécule COVID19 Fatty acid CD36 Molecular dynamics Molecular modeling Bioinformatics Molecule
design COVID19 األحماضالدهنية CD36 الدينامياتالجزيئية النمذجةالجزيئية المعلوماتيةالحيوية تصميمالجزيئات COVID19 | | Résumé : | Une consommation excessive de lipides en particulier d’Acides Gras Saturés associé à un
déséquilibre qualitatif contribue à la prévalence de l’obésité. Le récepteurs lipidiques CD36 est un
candidat plausible en tant que capteur lipidique gustatif, également induisant une cascade de
signalisation cellulaire. Le but de cette thèse a été la conception, le criblage et l'identification de
nouvelles molécules bioactives par le développement de workflow basés sur l’approche in silico.
Nous avons utilisé des séries de simulations de dynamique moléculaire de la protéine CD36, en
interaction avec un à trois acides palmitiques (PLM), afin d'établir un premier workflow pour
découvrir le mécanisme du fonctionnement du complexe CD36/Acides gras et de déterminer le rôle
structural de la Lys 164. Les résultats ont montré que la Lys164 influence d'une manière importante
sur la forme de stabilité du CD36 et. La conception grâce aux résultats du premier workflow de 15
molécules activant la voie de signalisation des acides gras et plus particulièrement ceux qui sont
spécifiques au goût de gras. Uniquement, l'analogue CIN4 a montré, par la suite, par criblage
dynamique, une dimérisation des deux domaines TM1 et TM2 qui ressemble à l'acide palmitique.
En outre, les étapes de ce premier workflow ont permis d'explorer le dysfonctionnement gustatif de
la chimio-réception des acides gras spécifiquement le "goût de gras" des patients testés positifs au
COVID-19. Les résultats de cette étude ont montré une affinité élevée et une stabilité du domaine
RBD du SARS-CoV-2 non mutant au récepteur CD36, un deuxième workflow a été établit. Le
criblage virtuel a été utilisé dans un premier temps pour identifier les épitopes critiques pour trois
cibles (CD147, CD209 et CD299). Les résultats ont montré une affinité élevée du domaine RBD du
SARS-CoV-2 pour le récepteur CD299. Le CD36 et CD299 représente, donc, une cible puissante
pour la découverte et la conception d'un nouveau groupe thérapeutiques ciblant le
dysfonctionnement du goût par le Covid 19 et neutralisant le SRAS-CoV-2. | | Numéro (Thèse ou Mémoire) : | D0322021 | | Président : | M’hammed ANSAR | | Directeur : | Rachid EL JAOUDI ; Azeddine IBRAHIMI Co-Directeur de thèse | | Juge : | Anas KETTANI | | Juge : | Khalil HAMMANI | | Juge : | EL HARTI Jaouad ; Youssef RAMLI |
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