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2 résultat(s) recherche sur le mot-clé 'Modélisation moléculaire' 
Affiner la recherche Faire une suggestionDrug Design. / Abdeljalil RAGHANI
Titre : Drug Design. Type de document : thèse Auteurs : Abdeljalil RAGHANI, Auteur Année de publication : 2018 Langues : Français (fre) Mots-clés : Modélisation moléculaire Pharmacophore Docking Criblage virtuel Bibliothèques des composés Résumé : Les approches actuelles de Drug Design sont basées sur les méthodes rationnelles ou combinatoires, dans les méthodes rationnelles, la conception de médicament basée sur le ligand est adoptée lorsque les ligands de la cible sont connus, dont on peut en synthétiser des analogues afin de tester leur activité, en corrélant leur activité biologique avec leur structure, on peut alors établir des règles pour améliorer les molécules testées et obtenir des médicaments. En revanche, la conception de médicament basée sur la structure repose sur la connaissance de la structure tridimensionnelle de la cible biologique obtenue par des méthodes telles que la cristallographie aux rayons X ou la spectroscopie RMN.
Tandis que les approches combinatoires consistent à tester des composés chimiques préalablement synthétisé un très grand nombre, dont on mesure par la suite l'effet de ce mélange sur l'activité biologique, et s'il s'avère qu'un effet est observé, un processus de déconvolution permettra alors de remonter au composé responsable de cette activité.
Diverses méthodes, dont le criblage virtuel, Docking, la conception pharmacophore et la simulation d'énergie libre, sont appliquées à la conception de molécules candidates et à leur affinité pour la cible.
Les approches de la conception tiennent également compte de la spécificité, des interactions entre les cibles, de la règle des cinq de Lipinski sur la « drug-likedness », de l'ADME et des propriétés de toxicité des molécules candidates. Les prédictions sont testées en laboratoire à l'aide de diverses méthodes de dépistage expérimentales. Le criblage à haut débit (HTS) peut être utilisé pour examiner les activités des bibliothèques de molécules par rapport à une cible.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0542018 Président : IBRAHIMI.A Directeur : EL HARTI.J Juge : FAOUZI.A Juge : ANSAR.M Drug Design. [thèse] / Abdeljalil RAGHANI, Auteur . - 2018.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Modélisation moléculaire Pharmacophore Docking Criblage virtuel Bibliothèques des composés Résumé : Les approches actuelles de Drug Design sont basées sur les méthodes rationnelles ou combinatoires, dans les méthodes rationnelles, la conception de médicament basée sur le ligand est adoptée lorsque les ligands de la cible sont connus, dont on peut en synthétiser des analogues afin de tester leur activité, en corrélant leur activité biologique avec leur structure, on peut alors établir des règles pour améliorer les molécules testées et obtenir des médicaments. En revanche, la conception de médicament basée sur la structure repose sur la connaissance de la structure tridimensionnelle de la cible biologique obtenue par des méthodes telles que la cristallographie aux rayons X ou la spectroscopie RMN.
Tandis que les approches combinatoires consistent à tester des composés chimiques préalablement synthétisé un très grand nombre, dont on mesure par la suite l'effet de ce mélange sur l'activité biologique, et s'il s'avère qu'un effet est observé, un processus de déconvolution permettra alors de remonter au composé responsable de cette activité.
Diverses méthodes, dont le criblage virtuel, Docking, la conception pharmacophore et la simulation d'énergie libre, sont appliquées à la conception de molécules candidates et à leur affinité pour la cible.
Les approches de la conception tiennent également compte de la spécificité, des interactions entre les cibles, de la règle des cinq de Lipinski sur la « drug-likedness », de l'ADME et des propriétés de toxicité des molécules candidates. Les prédictions sont testées en laboratoire à l'aide de diverses méthodes de dépistage expérimentales. Le criblage à haut débit (HTS) peut être utilisé pour examiner les activités des bibliothèques de molécules par rapport à une cible.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0542018 Président : IBRAHIMI.A Directeur : EL HARTI.J Juge : FAOUZI.A Juge : ANSAR.M Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité P0542018 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2018 Disponible P0542018-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2018 Disponible Documents numériques
P0542018URL
Titre : ETUDE DU MÉCANISME D’INTERACTION ET DE SIGNALISATION DES ACIDES GRAS VIA CD36 AVEC ET SANS INFECTION À LA COVID 19 : DÉVELOPPEMENT DE WORKFLOW D’IDENTIFICATION DE MOLÉCULES BIOACTIVES IN SILICO Type de document : thèse Auteurs : JIHANE AKACHAR, Auteur Année de publication : 2022 Langues : Français (fre) Mots-clés : Acide gras CD36 Dynamique moléculaire Modélisation moléculaire Bioinformatique Conception de molécule COVID19 Fatty acid CD36 Molecular dynamics Molecular modeling Bioinformatics Molecule
design COVID19 األحماضالدهنية CD36 الدينامياتالجزيئية النمذجةالجزيئية المعلوماتيةالحيوية تصميمالجزيئات COVID19Résumé : Une consommation excessive de lipides en particulier d’Acides Gras Saturés associé à un
déséquilibre qualitatif contribue à la prévalence de l’obésité. Le récepteurs lipidiques CD36 est un
candidat plausible en tant que capteur lipidique gustatif, également induisant une cascade de
signalisation cellulaire. Le but de cette thèse a été la conception, le criblage et l'identification de
nouvelles molécules bioactives par le développement de workflow basés sur l’approche in silico.
Nous avons utilisé des séries de simulations de dynamique moléculaire de la protéine CD36, en
interaction avec un à trois acides palmitiques (PLM), afin d'établir un premier workflow pour
découvrir le mécanisme du fonctionnement du complexe CD36/Acides gras et de déterminer le rôle
structural de la Lys 164. Les résultats ont montré que la Lys164 influence d'une manière importante
sur la forme de stabilité du CD36 et. La conception grâce aux résultats du premier workflow de 15
molécules activant la voie de signalisation des acides gras et plus particulièrement ceux qui sont
spécifiques au goût de gras. Uniquement, l'analogue CIN4 a montré, par la suite, par criblage
dynamique, une dimérisation des deux domaines TM1 et TM2 qui ressemble à l'acide palmitique.
En outre, les étapes de ce premier workflow ont permis d'explorer le dysfonctionnement gustatif de
la chimio-réception des acides gras spécifiquement le "goût de gras" des patients testés positifs au
COVID-19. Les résultats de cette étude ont montré une affinité élevée et une stabilité du domaine
RBD du SARS-CoV-2 non mutant au récepteur CD36, un deuxième workflow a été établit. Le
criblage virtuel a été utilisé dans un premier temps pour identifier les épitopes critiques pour trois
cibles (CD147, CD209 et CD299). Les résultats ont montré une affinité élevée du domaine RBD du
SARS-CoV-2 pour le récepteur CD299. Le CD36 et CD299 représente, donc, une cible puissante
pour la découverte et la conception d'un nouveau groupe thérapeutiques ciblant le
dysfonctionnement du goût par le Covid 19 et neutralisant le SRAS-CoV-2.Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0322021 Président : M’hammed ANSAR Directeur : Rachid EL JAOUDI ; Azeddine IBRAHIMI Co-Directeur de thèse Juge : Anas KETTANI Juge : Khalil HAMMANI Juge : EL HARTI Jaouad ; Youssef RAMLI ETUDE DU MÉCANISME D’INTERACTION ET DE SIGNALISATION DES ACIDES GRAS VIA CD36 AVEC ET SANS INFECTION À LA COVID 19 : DÉVELOPPEMENT DE WORKFLOW D’IDENTIFICATION DE MOLÉCULES BIOACTIVES IN SILICO [thèse] / JIHANE AKACHAR, Auteur . - 2022.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : Acide gras CD36 Dynamique moléculaire Modélisation moléculaire Bioinformatique Conception de molécule COVID19 Fatty acid CD36 Molecular dynamics Molecular modeling Bioinformatics Molecule
design COVID19 األحماضالدهنية CD36 الدينامياتالجزيئية النمذجةالجزيئية المعلوماتيةالحيوية تصميمالجزيئات COVID19Résumé : Une consommation excessive de lipides en particulier d’Acides Gras Saturés associé à un
déséquilibre qualitatif contribue à la prévalence de l’obésité. Le récepteurs lipidiques CD36 est un
candidat plausible en tant que capteur lipidique gustatif, également induisant une cascade de
signalisation cellulaire. Le but de cette thèse a été la conception, le criblage et l'identification de
nouvelles molécules bioactives par le développement de workflow basés sur l’approche in silico.
Nous avons utilisé des séries de simulations de dynamique moléculaire de la protéine CD36, en
interaction avec un à trois acides palmitiques (PLM), afin d'établir un premier workflow pour
découvrir le mécanisme du fonctionnement du complexe CD36/Acides gras et de déterminer le rôle
structural de la Lys 164. Les résultats ont montré que la Lys164 influence d'une manière importante
sur la forme de stabilité du CD36 et. La conception grâce aux résultats du premier workflow de 15
molécules activant la voie de signalisation des acides gras et plus particulièrement ceux qui sont
spécifiques au goût de gras. Uniquement, l'analogue CIN4 a montré, par la suite, par criblage
dynamique, une dimérisation des deux domaines TM1 et TM2 qui ressemble à l'acide palmitique.
En outre, les étapes de ce premier workflow ont permis d'explorer le dysfonctionnement gustatif de
la chimio-réception des acides gras spécifiquement le "goût de gras" des patients testés positifs au
COVID-19. Les résultats de cette étude ont montré une affinité élevée et une stabilité du domaine
RBD du SARS-CoV-2 non mutant au récepteur CD36, un deuxième workflow a été établit. Le
criblage virtuel a été utilisé dans un premier temps pour identifier les épitopes critiques pour trois
cibles (CD147, CD209 et CD299). Les résultats ont montré une affinité élevée du domaine RBD du
SARS-CoV-2 pour le récepteur CD299. Le CD36 et CD299 représente, donc, une cible puissante
pour la découverte et la conception d'un nouveau groupe thérapeutiques ciblant le
dysfonctionnement du goût par le Covid 19 et neutralisant le SRAS-CoV-2.Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0322021 Président : M’hammed ANSAR Directeur : Rachid EL JAOUDI ; Azeddine IBRAHIMI Co-Directeur de thèse Juge : Anas KETTANI Juge : Khalil HAMMANI Juge : EL HARTI Jaouad ; Youssef RAMLI Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité D0322021 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires Doctorat SVS 2021 Disponible
