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Titre : COMPUTATIONAL MODELING AND DRUG DISCOVERY IN THE CONTEXT OF HOST-PATHOGEN INTERACTIONS: APPLICATION TO SARS-COV-2 AND AGGREGATIBACTER ACTINOMYCETEMCOMITANS Type de document : thèse Auteurs : HAKMI MOHAMMED, Auteur Année de publication : 2023 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Host Pathogen Interaction Computational Modeling Molecular Dynamics Molecular Docking SARS-CoV-2 Aggregatibacter actinomycetemcomitans Hôte pathogène interaction modélisation informatique dynamique moléculaire amarrage moléculaire SARS-CoV-2 Aggregatibacter actinomycetemcomitans SARS-CoV-المضيف الممرض التفاعل النمذجة المعلوماتية، الديناميكيات الجزيئية الإرساء الجزيئي 2 Aggregatibacter actinomycetemcomitans Résumé : The study of host-pathogen interactions (HPIs) is crucial for understanding the mechanisms of infectious diseases and developing effective treatments. However, experimental methods for studying HPIs can be timeconsuming and yield limited results. As a result, computational methods have become an impressive tool for HPI prediction and modeling, given recent technological advances and the availability of vast amounts of genomic data. The aim of this thesis is to investigate proteomic interactions that offer insight into the critical molecular processes involved in infection mechanisms. Specifically, we focused on protein-protein interactions between the host and the pathogen, which present significant challenges related to infectious diseases and drug development. Using computational methods, we explored crucial drug targets from two human pathogens : SARS-CoV-2 and Aggregatibacter actinomycetemcomitans. For SARS-CoV-2, we examined two key proteins: the spike protein and the main protease. We investigated the interaction between the spike protein and the human ACE2 receptor and proposed novel compounds that disrupt this interaction and prevent the virus from infecting host cells. Additionally, we examined the use of existing antiviral agents to block the main protease's catalytic site and prevent its interaction with viral and possibly host proteins. For Aggregatibacter actinomycetemcomitans, we employed computational modeling and simulation to construct a high-resolution atomic model of its major virulence factor, the leukotoxin, and assessed its potential as a drug target. Furthermore, we established a computational model of the interaction between leukotoxin and its receptor LFA1, which could serve as a starting point for inhibitor design. Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0112023 Président : KETTANI Anass Directeur : IBRAHIMI Azeddine ; Jaouad El HARTI Juge : EL JAOUDI Rachid Juge : Khalil HAMMANI Juge : Samira SERRAGUI ; Oumkeltoum ENNIBI COMPUTATIONAL MODELING AND DRUG DISCOVERY IN THE CONTEXT OF HOST-PATHOGEN INTERACTIONS: APPLICATION TO SARS-COV-2 AND AGGREGATIBACTER ACTINOMYCETEMCOMITANS [thèse] / HAKMI MOHAMMED, Auteur . - 2023.
Langues : Anglais (eng)
Mots-clés : Host Pathogen Interaction Computational Modeling Molecular Dynamics Molecular Docking SARS-CoV-2 Aggregatibacter actinomycetemcomitans Hôte pathogène interaction modélisation informatique dynamique moléculaire amarrage moléculaire SARS-CoV-2 Aggregatibacter actinomycetemcomitans SARS-CoV-المضيف الممرض التفاعل النمذجة المعلوماتية، الديناميكيات الجزيئية الإرساء الجزيئي 2 Aggregatibacter actinomycetemcomitans Résumé : The study of host-pathogen interactions (HPIs) is crucial for understanding the mechanisms of infectious diseases and developing effective treatments. However, experimental methods for studying HPIs can be timeconsuming and yield limited results. As a result, computational methods have become an impressive tool for HPI prediction and modeling, given recent technological advances and the availability of vast amounts of genomic data. The aim of this thesis is to investigate proteomic interactions that offer insight into the critical molecular processes involved in infection mechanisms. Specifically, we focused on protein-protein interactions between the host and the pathogen, which present significant challenges related to infectious diseases and drug development. Using computational methods, we explored crucial drug targets from two human pathogens : SARS-CoV-2 and Aggregatibacter actinomycetemcomitans. For SARS-CoV-2, we examined two key proteins: the spike protein and the main protease. We investigated the interaction between the spike protein and the human ACE2 receptor and proposed novel compounds that disrupt this interaction and prevent the virus from infecting host cells. Additionally, we examined the use of existing antiviral agents to block the main protease's catalytic site and prevent its interaction with viral and possibly host proteins. For Aggregatibacter actinomycetemcomitans, we employed computational modeling and simulation to construct a high-resolution atomic model of its major virulence factor, the leukotoxin, and assessed its potential as a drug target. Furthermore, we established a computational model of the interaction between leukotoxin and its receptor LFA1, which could serve as a starting point for inhibitor design. Numéro (Thèse ou Mémoire) : D0112023 Président : KETTANI Anass Directeur : IBRAHIMI Azeddine ; Jaouad El HARTI Juge : EL JAOUDI Rachid Juge : Khalil HAMMANI Juge : Samira SERRAGUI ; Oumkeltoum ENNIBI Réservation
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Titre : Les interactions contenant-contenu: évaluation du phénomène d’adsorption médicamenteuse de sept anticancéreux sur des poches en PVC Type de document : thèse Auteurs : Boubacar Baye Fall DIOP, Auteur Année de publication : 2018 Langues : Français (fre) Mots-clés : interaction adsorption anticancéreux poche-pvc Résumé : Lors de la reconstitution d’un médicament, il existe des risques d’interaction entre celui-ci et la poche utilisée pour la préparation. Le PVC est un matériau entrant dans la fabrication d’une grande partie des poches de perfusion en chimiothérapie. Il est sujet à un certain nombre d’interactions : sorption des médicaments et relargage d’additifs de type phtalates.
Sept anticancéreux utilisés en oncologie pédiatrique ont été concernés par notre étude. Après reconstitution des anticancéreux dans des poches en PVC, le phénomène d’adsorption entre contenant et contenu est évalué par spectroscopie infrarouge par analyse de la surface interne du PVC. Par la suite, la confirmation du phénomène d’adsorption déterminé par analyse infrarouge est effectuée par spectrophotométrie UV-visible. Cette dernière permet d’examiner la cinétique de la concentration des anticancéreux reconstitués concernés.
Après analyse par spectroscopie infrarouge, toutes les poches en PVC ont donné un spectre identique au spectre de la poche de référence, sauf les poches utilisées pour reconstituer l’étoposide. Avec les absorbances mesurées par spectrophotométrie UV-visible aux différents temps, l’analyse statistique « Anova » montre qu’il existe une différence significative des absorbances entre T0 et tous les autres temps de mesure, par contre à partir de 24h on observe plus de différence significative entre les différents temps.
Ces résultats témoignent de l’existence d’une interaction contenant-contenu entre l’Etoposide et les poches en PVC. Ainsi, les préparations à base d’Etoposide pour une perfusion intraveineuse dans une poche en PVC devraient être utilisées immédiatement. Les pharmaciens hospitaliers en collaboration avec les chimistes analystes devraient étudier ce type d’interaction pour tous les matériaux et toutes les substances utilisées en oncologie afin d’assurer une meilleure efficacité thérapeutique.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0372018 Président : DRAOUI.M Directeur : BOUATIA.M Juge : EL HARTI.J Juge : EL KABABRI.M Les interactions contenant-contenu: évaluation du phénomène d’adsorption médicamenteuse de sept anticancéreux sur des poches en PVC [thèse] / Boubacar Baye Fall DIOP, Auteur . - 2018.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : interaction adsorption anticancéreux poche-pvc Résumé : Lors de la reconstitution d’un médicament, il existe des risques d’interaction entre celui-ci et la poche utilisée pour la préparation. Le PVC est un matériau entrant dans la fabrication d’une grande partie des poches de perfusion en chimiothérapie. Il est sujet à un certain nombre d’interactions : sorption des médicaments et relargage d’additifs de type phtalates.
Sept anticancéreux utilisés en oncologie pédiatrique ont été concernés par notre étude. Après reconstitution des anticancéreux dans des poches en PVC, le phénomène d’adsorption entre contenant et contenu est évalué par spectroscopie infrarouge par analyse de la surface interne du PVC. Par la suite, la confirmation du phénomène d’adsorption déterminé par analyse infrarouge est effectuée par spectrophotométrie UV-visible. Cette dernière permet d’examiner la cinétique de la concentration des anticancéreux reconstitués concernés.
Après analyse par spectroscopie infrarouge, toutes les poches en PVC ont donné un spectre identique au spectre de la poche de référence, sauf les poches utilisées pour reconstituer l’étoposide. Avec les absorbances mesurées par spectrophotométrie UV-visible aux différents temps, l’analyse statistique « Anova » montre qu’il existe une différence significative des absorbances entre T0 et tous les autres temps de mesure, par contre à partir de 24h on observe plus de différence significative entre les différents temps.
Ces résultats témoignent de l’existence d’une interaction contenant-contenu entre l’Etoposide et les poches en PVC. Ainsi, les préparations à base d’Etoposide pour une perfusion intraveineuse dans une poche en PVC devraient être utilisées immédiatement. Les pharmaciens hospitaliers en collaboration avec les chimistes analystes devraient étudier ce type d’interaction pour tous les matériaux et toutes les substances utilisées en oncologie afin d’assurer une meilleure efficacité thérapeutique.
Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0372018 Président : DRAOUI.M Directeur : BOUATIA.M Juge : EL HARTI.J Juge : EL KABABRI.M Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité P0372018 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2018 Disponible P0372018-1 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2018 Disponible Documents numériques
P0372018URL
Titre : LE PHARMACIEN CONSEILLER EN PHYTO-AROMATHERAPIE Type de document : thèse Auteurs : BELKHATTAB ABDELHAK, Auteur Année de publication : 2007 Langues : Français (fre) Mots-clés : PHYTOTHERAPIE AROMATHERAPIE INTERACTION TOXICITE CONSEIL Index. décimale : WA SANTE PUBLIQUE - PROFESSION MEDICALE Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0162007 Président : AGOUMI ABDELAZIZ Directeur : AGOUMI ABDELAZIZ Juge : LMIMOUNI BADREDDINE Juge : / Juge : / LE PHARMACIEN CONSEILLER EN PHYTO-AROMATHERAPIE [thèse] / BELKHATTAB ABDELHAK, Auteur . - 2007.
Langues : Français (fre)
Mots-clés : PHYTOTHERAPIE AROMATHERAPIE INTERACTION TOXICITE CONSEIL Index. décimale : WA SANTE PUBLIQUE - PROFESSION MEDICALE Numéro (Thèse ou Mémoire) : P0162007 Président : AGOUMI ABDELAZIZ Directeur : AGOUMI ABDELAZIZ Juge : LMIMOUNI BADREDDINE Juge : / Juge : / Réservation
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Code barre Cote Support Localisation Section Disponibilité P0162007 WA Thèse imprimé Unité des Thèses et Mémoires ThèsesPharm2007 Disponible
